Table 1.

Multifunctional LIRs and their non-Atg8–binding partners

Model LIR non-Atg8 partner Sequence 
Adjacent Atg19 (3x) Atg11 371 ASQEPFYSFQIDTLPELDDSSIISTSISLSYDGDDNEKALTWEEL 415 
Atg30 Atg11 68 TDNSEWILFSPENA..[24]..YNEDDILSSSRRSSEDVY 123 
Atg32 Atg11 81 SISGSWQAIQPLDL..[12]..TTNGSILSSSDTSEEEQE 124 
Atg36 Atg11 28 DEESLFEVLELSEE..[48]..SDEIAILSISSDSNKNSP 107 
NBR1 TAX1BP1 727 ASSEDYIIILPECFDTSRP 745 
CCPG1 FIP200 9 DSSCGWTVISHEGSDIEMLNSVTP 32 
p62 KEAP1 333 GGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQ 357 
Bipartite BNIP3 WIPIs 13 SLQGSWVELHFSNN..[14]..GDMEKILLDAQHESGRSS 58 
NIX WIPIs 31 GLNSSWVELPMNSS..[24]..GDMEKILLDAQHESGQSS 86 
Hybrid OPTN FIP200 173 SSEDSFVEIRMAEG 186 
p62 FIP200 333 GGDDDWTHLSSKEV 346 
TNIP1 FIP200 120 GTSSEFEVVTPEEQ 133 
NDP52 FIP200 129 NEEDILVVTTQGEV 142 
NAP1 FIP200 4 LVEDDICILNHEKA 17 
STBD1 FIP200 198 VDHEEWEMVPRHSS 211 
BCL2L13 FIP200 271 LGPESWQQIAMDPE 284 
FUNDC1 FIP200 13 SDDDSYEVLDLTEY 26 
CCPG1 FIP200 101 SDDSDIVTLEPPKL 114 
NBR1 FIP200 727 ASSEDYIIILPECF 740 
C53 (4x) UFM1 (3x) 269 AAADSIDWDITVETPEIDWDVS..[11]..GSYEIVNA..[21]..SEISWDVSVET 341 
Uba5 UFM1 335 IHEDNEWGIELVSEVSEEELKN 356 
Atg19 (3x) Atg5 (3x) 371 ASQEPFYSFQIDTLPELDDSSIISTSISLSYDGDDNEKALTWEEL 415 
Model LIR non-Atg8 partner Sequence 
Adjacent Atg19 (3x) Atg11 371 ASQEPFYSFQIDTLPELDDSSIISTSISLSYDGDDNEKALTWEEL 415 
Atg30 Atg11 68 TDNSEWILFSPENA..[24]..YNEDDILSSSRRSSEDVY 123 
Atg32 Atg11 81 SISGSWQAIQPLDL..[12]..TTNGSILSSSDTSEEEQE 124 
Atg36 Atg11 28 DEESLFEVLELSEE..[48]..SDEIAILSISSDSNKNSP 107 
NBR1 TAX1BP1 727 ASSEDYIIILPECFDTSRP 745 
CCPG1 FIP200 9 DSSCGWTVISHEGSDIEMLNSVTP 32 
p62 KEAP1 333 GGDDDWTHLSSKEVDPSTGELQSLQ 357 
Bipartite BNIP3 WIPIs 13 SLQGSWVELHFSNN..[14]..GDMEKILLDAQHESGRSS 58 
NIX WIPIs 31 GLNSSWVELPMNSS..[24]..GDMEKILLDAQHESGQSS 86 
Hybrid OPTN FIP200 173 SSEDSFVEIRMAEG 186 
p62 FIP200 333 GGDDDWTHLSSKEV 346 
TNIP1 FIP200 120 GTSSEFEVVTPEEQ 133 
NDP52 FIP200 129 NEEDILVVTTQGEV 142 
NAP1 FIP200 4 LVEDDICILNHEKA 17 
STBD1 FIP200 198 VDHEEWEMVPRHSS 211 
BCL2L13 FIP200 271 LGPESWQQIAMDPE 284 
FUNDC1 FIP200 13 SDDDSYEVLDLTEY 26 
CCPG1 FIP200 101 SDDSDIVTLEPPKL 114 
NBR1 FIP200 727 ASSEDYIIILPECF 740 
C53 (4x) UFM1 (3x) 269 AAADSIDWDITVETPEIDWDVS..[11]..GSYEIVNA..[21]..SEISWDVSVET 341 
Uba5 UFM1 335 IHEDNEWGIELVSEVSEEELKN 356 
Atg19 (3x) Atg5 (3x) 371 ASQEPFYSFQIDTLPELDDSSIISTSISLSYDGDDNEKALTWEEL 415 

Multifunctional LIR motif sequences are shown, with the core LIR (underlined), non-Atg8 motifs (bold), and overlapping motifs (underlined and bold) indicated. Only the core LIR residues are marked, although flanking residues often contribute critically to LIR function. Motifs are categorized by how each non-Atg8 motif is integrated with its corresponding LIR—adjacent, bipartite, and hybrid—in order of increasing overlap.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal