Plasmids and primers used in this study
| Plasmid | Plasmid backbone | Sequence, 5′-3′ |
| Expression in Dictyostelium cells | ||
| GFP-Leep2A | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| Flag-Leep2A | pDM320 | F: 5′-AGATGATGATGATAAAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-TAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTAAATTGGTGAAGGTATACC-3′ | ||
| RFP-Leep2A | pDM449 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2AΔGAP | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACACCACCTTGACTATTGTATTGTTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-1344 (T1) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTATTCCAATTGACGTAGAGTGTTGGTATAG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-1100 (T2) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTAAATGAATTCTGCACCTTGTTTTGATG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-446 (T3) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTGATTCTGCTTCGAATACATGTAAC-3′ | ||
| GFP-Leep2A447-1100 (T4) | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGCAAAATTTTGAAAAAGAGAGAGAAGC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTAAATGAATTCTGCACCTTGTTTTGATG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1101-1344 (T5) | pDM317 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGAGTTCAATGATTGATGAAGAAG-3′ |
| R: 5′-TTAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTCCAATTGACGTAGAGTGTTGG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1345-1640 (T6) | pDM317 | F: 5′-GAAGATCTATGTCAACAAATAAATTAAGTCGTGCTC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2AN1474K | pDM317 | F: 5′-TCATGTGGGTAAAGATATTGTAAACATCATTTG-3′ |
| R: 5′-ACAATATCTTTACCCACATGACGTTTCTTATGAATTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2B | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| GFP-Leep2B | pDM317-HygR | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| RFP-Leep2B | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| RFP-Leep2BΔGAP | pDM449 | F: 5′-CCGGATCCATGATTACAAACTCATTTACTAATA-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGAATCGTCTTCGGTTGAGTCACCCTT-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-1264 (T1) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R:5′-GTCGACTTACTCCAATGGTGTCAATTTATTTCTATTC-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-1010 (T2) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R:5′-GTCGACTTAGGTATTGGTTGGTGTAGCATTATATGG-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-400 (T3) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTAGTCGACACTATTGGAATGAATACCAAGTATAC-3′ | ||
| RFP-Leep2B401-1010 (T4) | pDM449 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGGAAATGTTGGCACGTAATTTATG-3′ |
| R: 5′-TAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTAGGTATTGGTTGGTGTAGCATTATATG-3′ | ||
| RFP-Leep2B1011-1264 (T5) | pDM449 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGTCATCAAAAGTAACCGAATCTG-3′ |
| R: 5′-TTAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTACTCCAATGGTGTCAATTTATTTCTATTC-3′ | ||
| RFP-Leep2B1265-1619 (T6) | pDM449 | F: 5′-TGCTCTAGAATGAATAGTGTTCAATTTTTCCAATCTTTAAATATG-3′ |
| R: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| Leep2B | pDM344 | F: 5′-CCGGATCCTACCCATACGATGTTCCAGATTACGCTATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGATTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| Leep2BΔGAP | pDM344 | F: 5′-CCGGATCCTACCCATACGATGTTCCAGATTACGCTATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGAATCGTCTTCGGTTGAGTCACCCTT-3′ | ||
| GFP-RasB | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GGACTAGTCTAAAGGATTAAACAATCACCACC-3′ | ||
| GFP-RasD | pDM317 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| GFP-RasG | pDM317 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| GFP-RasBG15V | pDM371 | F: 5′-GGAAGATCTATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GGACTAGTCTAAAGGATTAAACAATCACCACC-3′ | ||
| F: 5′-TTGTTATGGGTGGTGTTGGTGTTGGTAAGAGTG-3′ | ||
| R: 5′-TCTTACCAACACCAACACCACCCATAACAACTAATTTATATTC-3′ | ||
| GFP-RasDQ61L | pDM371 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| F: 5′-ACTGCAGGTTTAGAGGAATATAGTGCAATG-3′ | ||
| R: 5′-TATTCCTCTAAACCTGCAGTATCTAAAATATCTAATAAAC-3′ | ||
| GFP-RasGG12V | pDM371 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| F: 5′-TGTTGGTGGTGTTGGTGTCGGTAAAAGTGCCTTAAC-3′ | ||
| R: 5′-TTTACCGACACCAACACCACCAACAATAACTAATTTGTATTC-3′ | ||
| Gene distruption | ||
| leep2A KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CGGGGTACCCAATCCTCACAATCACCAGTTGCG-3′ |
| ARM1-R: 5′-CCCAAGCTTGTACATTTTCAATACCTAACATTTTCT-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CGGGGATCCGGTTGAGGCCATCTTTCACGATATC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-CCGGCGGCCGCAATTGTTGATGGTGGAGTTGTTGAAG-3′ | ||
| P1: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| leep2B KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CCGGTACCATGATTACAAACTCATTTACTAA-3′ |
| ARM1-R: 5′-CAAGCTTTGGTGAATTATTATTACTTGATTC-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CCGGATCCATTAGTAAACATATACTTGCC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-ATAAGGCGGCCGCTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| P1: 5′-ATGTTTCTTGACTGGGCCTCATCC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-CCCAGTCATTGCACCAGCCAAGCC-3′ | ||
| rasB KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CGGGGTACCCAATTCCAATAGTAAAAAGTC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CTGGTCGACGGATAGTAAGTGCACTCTTACTG-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CGGGATCCGTCAAGATGATTACAGTGCTA-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-CCGGCGGCCGCCTTTGATCTGCCTGGCTCTTTG-3′ | ||
| P1: 5′-AAAAAGTATGAGATTTTTAAAGTTGG-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P4: 5′-ATCATCTTGACCTGCAGTATC-3′ | ||
| rasD KO | pDM1801 | ARM1-F: 5′-ATTGCCGGCTTGAATAGATATAAGAGGTCATATTC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CCCAAGCTTACCACCTACAATAACTAATTTATATTCTGTC-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-GGAAGATCTATCAATCAAGTGGCAAAGCTC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-GGAACTAGTACTACAAGCACTTTTCCAGATACC-3′ | ||
| P1: 5′-ATCTATTTGTCAGTGAATTTATACC-3′ | ||
| P2: 5′-TTTATCGGCACTTTGCATCGG-3′ | ||
| P3: 5′-AAACTTCTCGACAGACGTCG-3′ | ||
| P4: 5′-TAAATCCTGCCAATGTAATTTCAGTAC-3′ | ||
| P5: 5′-TATGATCCAACAATTGAAGATAGTTATCG-3′ | ||
| P6: 5′-AATTCTACTTTTAGCAGATGACTCC-3′ | ||
| rasG KO | pLPBLP | ARM1-F: 5′-GAATTCATCTACACATGCGATTAACTGCCAC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CATTGATGAATACGATCCAACTATCG-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-GCGGCCGCGTGTCTACTCTATCACTTCAAG-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-GTAAATTAGAAATAATAATTCAACCACCGCGG-3′ | ||
| P1: 5′-AAATCTACACATGCGATTAAC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-TTTTAATTGATCGGATTGGA-3′ | ||
| Expression in bacteria | ||
| GST-RapA | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGCCTCTTAGAGAATTCAAAATCG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACAATAAAGCACATTTTGATTTAGC-3′ | ||
| GST-RapB | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGGGTAAGGGAAATGGTAAATC-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACATAATGATACATTTTTCTTTT-3′ | ||
| GST-RapC | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGCAAACCTATAAAGTAGTTGTTTTG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACATGATTAAACATTTTCCTTTTG-3′ | ||
| GST-RanA | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGGCAGAAAAAGAACAAATTAAATTAG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACAAGTCATCATTGTCTTCTGG-3′ | ||
| GST-RasB | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCCTAAAGGATTAAACAATCACCAC-3′ | ||
| GST-RasC | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTCAAAATTATTAAAATTAGTTATCGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTACAATATAATACATCCCCTTTTCTTTGG-3′ | ||
| GST-RasD | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| GST-RasG | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| GST-RasS | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTTTAATTTTAAATTAGTATTAGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAATAAATTACAAGATTTCTTTTTTTTAATTGGTTG-3′ | ||
| GST-RasU | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAGCCTTTATATATAATAACAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTATATCATTTTACAAATAGAATGAAATG-3′ | ||
| GST-RasV | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAATTAAAATTAAAAATTTTAAAAAAAATA-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATAACTTTACAAATTTCATTAATTTTTTTTTTTAATG-3′ | ||
| GST-RasW | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGACTTCCTATAAAAATAATAATG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAAGTTTTAG-3′ | ||
| GST-RasX | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAGGATATAAAAATAATAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAATTTTTAG-3′ | ||
| GST-RasY | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGACAACAAATAAAAGTAATGGTAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGATATTTTGGC-3′ | ||
| GST-RasZ | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGGCATCATATAAAAATAATAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAGGTTTTAG-3′ | ||
| Yeast two-hybrid | ||
| Leep2A1359-1560 | pGADT7 | F: 5′-CGCCATATGACTCCTGGTCGTGAAATCTTAAAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATGGAGTATTATGACGAACATAACG-3′ | ||
| RasBQ64L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAATCACCACCTTTAAACTTTTTAAGG-3′ | ||
| RasCQ62L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAAAATTATTAAAATTAGTTATC-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATCCCCTTTTCTTTGGTGGG-3′ | ||
| RasDQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAGAATATAAATTAGTTATTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| RasGQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAGAATACAAATTAGTTATTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAGCTTTTAATGGTCTCTTC-3′ | ||
| RasSQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTTTAATTTTAAATTAGTATTAGTTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAGATTTCTTTTTTTTAATTGG-3′ | ||
| RasUQ72L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGTCAGCCTTTATATATAATAACAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATAGAATGAAATGTATTATTTAATTTTTG-3′ | ||
| RasVQ91L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAATTAAAATTAAAAATTTTA-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTTCATTAATTTTTTTTTTTAATGG-3′ | ||
| RasWQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACTTCCTATAAAAATAATAATG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAAGTTTTAGTTTG-3′ | ||
| RasXQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAGGATATAAAAATAATAAT-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAATTTTTAGTATTATTTAC-3′ | ||
| RasYQ68L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAACAAATAAAAGTAATGG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGATATTTTGGCACCATTTACTTTTTG-3′ | ||
| RasZQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGGCATCATATAAAAATAATAAT-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAGGTTTTAGTATTATTTAC-3′ | ||
| RanAQ65L | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGGCAGAAAAAGAACAAATTAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GCGGATCCTTACAAGTCATCATTGTCTTCTGG-3′ | ||
| RapAQ65E ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGCCTCTTAGAGAATTCAAAATCG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATTTTGATTTAGCTTTGCTTGG-3′ | ||
| Plasmid | Plasmid backbone | Sequence, 5′-3′ |
| Expression in Dictyostelium cells | ||
| GFP-Leep2A | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| Flag-Leep2A | pDM320 | F: 5′-AGATGATGATGATAAAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-TAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTAAATTGGTGAAGGTATACC-3′ | ||
| RFP-Leep2A | pDM449 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2AΔGAP | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACACCACCTTGACTATTGTATTGTTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-1344 (T1) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTATTCCAATTGACGTAGAGTGTTGGTATAG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-1100 (T2) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTAAATGAATTCTGCACCTTGTTTTGATG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1-446 (T3) | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTGATTCTGCTTCGAATACATGTAAC-3′ | ||
| GFP-Leep2A447-1100 (T4) | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGCAAAATTTTGAAAAAGAGAGAGAAGC-3′ |
| R: 5′-GTCGACTTAAATGAATTCTGCACCTTGTTTTGATG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1101-1344 (T5) | pDM317 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGAGTTCAATGATTGATGAAGAAG-3′ |
| R: 5′-TTAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTCCAATTGACGTAGAGTGTTGG-3′ | ||
| GFP-Leep2A1345-1640 (T6) | pDM317 | F: 5′-GAAGATCTATGTCAACAAATAAATTAAGTCGTGCTC-3′ |
| R: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2AN1474K | pDM317 | F: 5′-TCATGTGGGTAAAGATATTGTAAACATCATTTG-3′ |
| R: 5′-ACAATATCTTTACCCACATGACGTTTCTTATGAATTTG-3′ | ||
| GFP-Leep2B | pDM317 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| GFP-Leep2B | pDM317-HygR | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| RFP-Leep2B | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| F: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| RFP-Leep2BΔGAP | pDM449 | F: 5′-CCGGATCCATGATTACAAACTCATTTACTAATA-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGAATCGTCTTCGGTTGAGTCACCCTT-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-1264 (T1) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R:5′-GTCGACTTACTCCAATGGTGTCAATTTATTTCTATTC-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-1010 (T2) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R:5′-GTCGACTTAGGTATTGGTTGGTGTAGCATTATATGG-3′ | ||
| RFP-Leep2B1-400 (T3) | pDM449 | F: 5′-CTATCTAGAATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTAGTCGACACTATTGGAATGAATACCAAGTATAC-3′ | ||
| RFP-Leep2B401-1010 (T4) | pDM449 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGGAAATGTTGGCACGTAATTTATG-3′ |
| R: 5′-TAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTAGGTATTGGTTGGTGTAGCATTATATG-3′ | ||
| RFP-Leep2B1011-1264 (T5) | pDM449 | F: 5′-TCTAGAAAAGGTACCAAAAGATCTATGTCATCAAAAGTAACCGAATCTG-3′ |
| R: 5′-TTAAATAATTTATTTATTTAACTAGTTTACTCCAATGGTGTCAATTTATTTCTATTC-3′ | ||
| RFP-Leep2B1265-1619 (T6) | pDM449 | F: 5′-TGCTCTAGAATGAATAGTGTTCAATTTTTCCAATCTTTAAATATG-3′ |
| R: 5′-CTAGTCGACTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| Leep2B | pDM344 | F: 5′-CCGGATCCTACCCATACGATGTTCCAGATTACGCTATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGATTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| Leep2BΔGAP | pDM344 | F: 5′-CCGGATCCTACCCATACGATGTTCCAGATTACGCTATGATTACAAACTCATTTACTAATAATTTTC-3′ |
| R: 5′-CTATCTAGAATCGTCTTCGGTTGAGTCACCCTT-3′ | ||
| GFP-RasB | pDM317 | F: 5′-GGAAGATCTATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GGACTAGTCTAAAGGATTAAACAATCACCACC-3′ | ||
| GFP-RasD | pDM317 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| GFP-RasG | pDM317 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| GFP-RasBG15V | pDM371 | F: 5′-GGAAGATCTATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GGACTAGTCTAAAGGATTAAACAATCACCACC-3′ | ||
| F: 5′-TTGTTATGGGTGGTGTTGGTGTTGGTAAGAGTG-3′ | ||
| R: 5′-TCTTACCAACACCAACACCACCCATAACAACTAATTTATATTC-3′ | ||
| GFP-RasDQ61L | pDM371 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| F: 5′-ACTGCAGGTTTAGAGGAATATAGTGCAATG-3′ | ||
| R: 5′-TATTCCTCTAAACCTGCAGTATCTAAAATATCTAATAAAC-3′ | ||
| GFP-RasGG12V | pDM371 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-GGAACTAGTTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| F: 5′-TGTTGGTGGTGTTGGTGTCGGTAAAAGTGCCTTAAC-3′ | ||
| R: 5′-TTTACCGACACCAACACCACCAACAATAACTAATTTGTATTC-3′ | ||
| Gene distruption | ||
| leep2A KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CGGGGTACCCAATCCTCACAATCACCAGTTGCG-3′ |
| ARM1-R: 5′-CCCAAGCTTGTACATTTTCAATACCTAACATTTTCT-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CGGGGATCCGGTTGAGGCCATCTTTCACGATATC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-CCGGCGGCCGCAATTGTTGATGGTGGAGTTGTTGAAG-3′ | ||
| P1: 5′-GGAAGATCTATGAGCTCAACAGCGAATAATTCAC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-GCTCTAGAAATTGGTGAAGGTATACCAATTGTTG-3′ | ||
| leep2B KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CCGGTACCATGATTACAAACTCATTTACTAA-3′ |
| ARM1-R: 5′-CAAGCTTTGGTGAATTATTATTACTTGATTC-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CCGGATCCATTAGTAAACATATACTTGCC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-ATAAGGCGGCCGCTTTATGAGATTGATCTTCAGATTG-3′ | ||
| P1: 5′-ATGTTTCTTGACTGGGCCTCATCC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-CCCAGTCATTGCACCAGCCAAGCC-3′ | ||
| rasB KO | pBluescript-BSR | ARM1-F: 5′-CGGGGTACCCAATTCCAATAGTAAAAAGTC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CTGGTCGACGGATAGTAAGTGCACTCTTACTG-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-CGGGATCCGTCAAGATGATTACAGTGCTA-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-CCGGCGGCCGCCTTTGATCTGCCTGGCTCTTTG-3′ | ||
| P1: 5′-AAAAAGTATGAGATTTTTAAAGTTGG-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P4: 5′-ATCATCTTGACCTGCAGTATC-3′ | ||
| rasD KO | pDM1801 | ARM1-F: 5′-ATTGCCGGCTTGAATAGATATAAGAGGTCATATTC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CCCAAGCTTACCACCTACAATAACTAATTTATATTCTGTC-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-GGAAGATCTATCAATCAAGTGGCAAAGCTC-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-GGAACTAGTACTACAAGCACTTTTCCAGATACC-3′ | ||
| P1: 5′-ATCTATTTGTCAGTGAATTTATACC-3′ | ||
| P2: 5′-TTTATCGGCACTTTGCATCGG-3′ | ||
| P3: 5′-AAACTTCTCGACAGACGTCG-3′ | ||
| P4: 5′-TAAATCCTGCCAATGTAATTTCAGTAC-3′ | ||
| P5: 5′-TATGATCCAACAATTGAAGATAGTTATCG-3′ | ||
| P6: 5′-AATTCTACTTTTAGCAGATGACTCC-3′ | ||
| rasG KO | pLPBLP | ARM1-F: 5′-GAATTCATCTACACATGCGATTAACTGCCAC-3′ |
| ARM1-R: 5′-CATTGATGAATACGATCCAACTATCG-3′ | ||
| ARM2-F: 5′-GCGGCCGCGTGTCTACTCTATCACTTCAAG-3′ | ||
| ARM2-R: 5′-GTAAATTAGAAATAATAATTCAACCACCGCGG-3′ | ||
| P1: 5′-AAATCTACACATGCGATTAAC-3′ | ||
| P2: 5′-GTAGCGACAGAGAAGATTACAATGC-3′ | ||
| P3: 5′-TCGGGTATATTTGAGTGGAATGAG-3′ | ||
| P4: 5′-TTTTAATTGATCGGATTGGA-3′ | ||
| Expression in bacteria | ||
| GST-RapA | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGCCTCTTAGAGAATTCAAAATCG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACAATAAAGCACATTTTGATTTAGC-3′ | ||
| GST-RapB | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGGGTAAGGGAAATGGTAAATC-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACATAATGATACATTTTTCTTTT-3′ | ||
| GST-RapC | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGCAAACCTATAAAGTAGTTGTTTTG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACATGATTAAACATTTTCCTTTTG-3′ | ||
| GST-RanA | pGEX-6p-1 | F: 5′-GCGGATCCATGGCAGAAAAAGAACAAATTAAATTAG-3′ |
| R: 5′-ACGCGTCGACTTACAAGTCATCATTGTCTTCTGG-3′ | ||
| GST-RasB | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCCTAAAGGATTAAACAATCACCAC-3′ | ||
| GST-RasC | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTCAAAATTATTAAAATTAGTTATCGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTACAATATAATACATCCCCTTTTCTTTGG-3′ | ||
| GST-RasD | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATATAAATTAGTTATTGTAGGTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAAAATTAAACATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| GST-RasG | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGACAGAATACAAATTAGTTATTGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAAAAGAGTACAAGCTTTTAATGGTC-3′ | ||
| GST-RasS | pGEX-6p-1 | F: 5′-GGGGATCCATGTTTAATTTTAAATTAGTATTAGTTGG-3′ |
| R: 5′-CGGAATTCTTATAATAAATTACAAGATTTCTTTTTTTTAATTGGTTG-3′ | ||
| GST-RasU | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAGCCTTTATATATAATAACAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTATATCATTTTACAAATAGAATGAAATG-3′ | ||
| GST-RasV | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAATTAAAATTAAAAATTTTAAAAAAAATA-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATAACTTTACAAATTTCATTAATTTTTTTTTTTAATG-3′ | ||
| GST-RasW | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGACTTCCTATAAAAATAATAATG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAAGTTTTAG-3′ | ||
| GST-RasX | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGTCAGGATATAAAAATAATAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAATTTTTAG-3′ | ||
| GST-RasY | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGACAACAAATAAAAGTAATGGTAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGATATTTTGGC-3′ | ||
| GST-RasZ | pGEX-6p-1 | F: 5′-CGGGATCCATGGCATCATATAAAAATAATAATTTAG-3′ |
| R: 5′-GAGTCGACTTACATCATTTTACAAATTGAGGTTTTAG-3′ | ||
| Yeast two-hybrid | ||
| Leep2A1359-1560 | pGADT7 | F: 5′-CGCCATATGACTCCTGGTCGTGAAATCTTAAAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATGGAGTATTATGACGAACATAACG-3′ | ||
| RasBQ64L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAGTTTCAAATGAATATAAATTAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAATCACCACCTTTAAACTTTTTAAGG-3′ | ||
| RasCQ62L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAAAATTATTAAAATTAGTTATC-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATCCCCTTTTCTTTGGTGGG-3′ | ||
| RasDQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAGAATATAAATTAGTTATTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATTGTTTTTTCTTTTTTTGAGC-3′ | ||
| RasGQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAGAATACAAATTAGTTATTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAGCTTTTAATGGTCTCTTC-3′ | ||
| RasSQ61L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTTTAATTTTAAATTAGTATTAGTTG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAGATTTCTTTTTTTTAATTGG-3′ | ||
| RasUQ72L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGTCAGCCTTTATATATAATAACAG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATAGAATGAAATGTATTATTTAATTTTTG-3′ | ||
| RasVQ91L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAATTAAAATTAAAAATTTTA-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTTCATTAATTTTTTTTTTTAATGG-3′ | ||
| RasWQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACTTCCTATAAAAATAATAATG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAAGTTTTAGTTTG-3′ | ||
| RasXQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGTCAGGATATAAAAATAATAAT-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAATTTTTAGTATTATTTAC-3′ | ||
| RasYQ68L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGACAACAAATAAAAGTAATGG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGATATTTTGGCACCATTTACTTTTTG-3′ | ||
| RasZQ67L ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-CGGAATTCATGGCATCATATAAAAATAATAAT-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTAAATTGAGGTTTTAGTATTATTTAC-3′ | ||
| RanAQ65L | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGGCAGAAAAAGAACAAATTAAATTAG-3′ |
| R: 5′-GCGGATCCTTACAAGTCATCATTGTCTTCTGG-3′ | ||
| RapAQ65E ΔCAAX | pGBKT7 | F: 5′-GGCATATGCCTCTTAGAGAATTCAAAATCG-3′ |
| R: 5′-CGGGATCCTTATTTTGATTTAGCTTTGCTTGG-3′ | ||