Table 1.

Clinical characteristics and presence of CH in a cohort of 66 patients with CAC

CAC case #GeneProtein changeVariant allele frequencyIBD typeAge at cancer diagnosis (years)Cancer stage at diagnosisPrimary siteClassification of primary siteVital status (0 = alive, 1 = dead)Overall survival from cancer diagnosis (months)Site of first metastasisChemo exposure before sequencing
1    UC 55 3 R colon Right (R) side 1 30.4 Liver Y 
2    UC 55 3 Rectum Left (L) side 1 43.7 Bone Y 
3    UC 44 1 Rectum L side 1 116.4 Lung N 
4    UC 29 3 Rectum L side 0 155.7 Pelvis Y 
5    UC 48 3 Sigmoid colon L side 1 35.5 Peritoneum, small intestine Y 
6    Crohn’s 57 2 Rectum L side 0 61.1 N/A N 
7    Crohn’s 55 3 Ascending colon R side 1 18.7 Lung, peritoneum Y 
8 MGA R2529Kfs*9 0.124 Crohn’s 64 4 Descending colon L side 1 1.9 Peritoneum N 
9 CHEK2 A392V 0.071 Crohn’s 70 4 Sigmoid L side 0 120.3 Liver Y 
10 DNMT3A C494F 0.035 UC 36 4 Rectosigmoid L side 1 131.2 Liver Y 
11    Crohn’s 48 4 L colon L side 1 18.1 Peritoneum N 
12    Crohn’s 29 3 Sigmoid L side 1 34.0 Peritoneum, pelvis Y 
13    Crohn’s 37 2 Ileum R side 0 0.7 N/A N 
14    UC 31 4 Transverse colon R side 1 32.2 Liver Y 
15    Crohn’s 54 1 Rectal L side 0 67.0 N/A N 
16    Crohn’s 43 3 Rectal L side 1 55.0 Lymph nodes Y 
17 MDC1 R1882* 0.02 Crohn’s 35 4 Rectal L side 1 19.9 Liver, lung, bone N 
18    UC 55 4 Sigmoid L side 1 5.0 Pelvis, ovary Y 
19 ABL1 S1120L 0.043 Crohn’s 58 3 Rectal L side 1 31.0 Pelvis Y 
20    Crohn’s 57 3 Rectal L side 1 28.3 Peritoneum N 
21    Crohn’s 57 3 Small intestine Small intestine 1 56.8 Peritoneum Y 
22    Crohn’s 52 2 Ileum Small intestine 0 52.8 N/A N 
23    Crohn’s 38 2 Ileum Small intestine 0 50.8 N/A N 
24    UC 45 1 Rectal L side 0 60.3 N/A N 
25    Crohn’s 57 4 Ileum Small intestine 1 17.5 Liver N 
26 DNMT3A R742Gfs*37 0.03 Crohn’s 35 4 Rectum L side 1 13.5 Liver Y 
27    Crohn’s 38 3 Rectal L side 0 83.9 Pelvis Y 
28 DNMT3B R497Q 0.028 UC 67 3 Rectosigmoid L side 0 43.4 N/A N 
29    Crohn’s 51 3 Rectum L side 0 40.7 Lymph nodes N 
30    UC 51 3 Sigmoid L side 1 34.5 Liver Y 
31    UC 65 4 Distal transverse L side 1 44.9 Liver Y 
32    UC 52 3 Rectum L side 1 20.9 Lung, liver, bone N 
33    Crohn’s 64 2 Small intestine Small intestine 1 18.6 Bone, liver, lymph nodes, lungs N 
34    Crohn’s 43 4 Rectum L side 0 23.2 Skin Y 
35    Crohn’s 46 4 Transverse colon R side 0 32.4 Peritoneum N 
36    UC 62 4 Rectum L side 1 42.9 Liver, lymph nodes Y 
37    Crohn’s 70 2 Ileum Small intestine 0 88.6 Lung, lymph nodes Y 
38    UC 75 4 Sigmoid L side 1 8.5 Pelvis Y 
39    Crohn’s 57 3 Anal fistula Anal fistula 0 33.3 Lymph nodes Y 
40    UC 63 0 Descending colon L side 0 25.0 N/A N 
41    Crohn’s 60 4 Ileum Small intestine 1 13.4 Liver Y 
42    UC 67 1 Rectosigmoid L side 0 60.8 N/A N 
43    UC 49 1 Rectum L side 0 57.4 N/A N 
44    UC 56 3 Transverse colon, descending L side 0 20.5 N/A N 
45    Crohn’s 37 2 Cecum R side 0 21.5 N/A N 
46    Crohn’s 39 4 Cecum R side 0 9.7 Liver Y 
47    UC 36 4 Ascending colon R side 1 7.2 Liver Y 
48    UC 63 2 Descending colon L side 0 22.7 N/A Y 
49    UC 54 4 Rectum L side 0 19.5 Liver N 
50    Crohn’s 53 4 Splenic flexure L side 0 26.4 Peritoneum Y 
51    Crohn’s 38 3 Sigmoid L side 0 1.6 N/A N 
52    UC 52 4 Rectum L side 0 19.3 Lymph nodes N 
53    UC 32 4 Transverse colon R side 0 22.2 Liver N 
54 CREBBP R2344W 0.013 Crohn’s 36 3 Ascending colon R side 0 2.8 N/A N 
 SH2B3 H158P 0.023          
55    UC 50 3 Rectum L side 0 18.2 N/A N 
56    Crohn’s 43 4 Cecum R side 0 35.3 Liver Y 
57    UC 56 4 Sigmoid L side 0 19.1 Peritoneum, ovaries N 
58 DNMT3A R882H 0.015 UC 45 4 Rectum L side 0 28.9 Lymph nodes Y 
 PBRM1 R836Q 0.076          
59    UC 36 4 Sigmoid L side 1 12.2 Peritoneum N 
60    Crohn’s 64 1 Rectum L side 0 20.3 N/A N 
61    Crohn’s 49 1 Ileum Small intestine 0 5.3 N/A N 
62    Crohn’s 63 4 Cecum / terminal ileum R side 0 5.9 Liver, regional nodal, peritoneum N 
63    UC 69 CIS (0) Rectum L side 0 2.7 N/A N 
64    UC 46 4 Rectosigmoid L side 0 3.7 Peritoneum N 
65    UC 32 4 Ascending colon R side 1 14.8 Peritoneum N 
66    Crohn’s 24 4 Hepatic flexure R side 0 0.5 Lymph nodes N 
CAC case #GeneProtein changeVariant allele frequencyIBD typeAge at cancer diagnosis (years)Cancer stage at diagnosisPrimary siteClassification of primary siteVital status (0 = alive, 1 = dead)Overall survival from cancer diagnosis (months)Site of first metastasisChemo exposure before sequencing
1    UC 55 3 R colon Right (R) side 1 30.4 Liver Y 
2    UC 55 3 Rectum Left (L) side 1 43.7 Bone Y 
3    UC 44 1 Rectum L side 1 116.4 Lung N 
4    UC 29 3 Rectum L side 0 155.7 Pelvis Y 
5    UC 48 3 Sigmoid colon L side 1 35.5 Peritoneum, small intestine Y 
6    Crohn’s 57 2 Rectum L side 0 61.1 N/A N 
7    Crohn’s 55 3 Ascending colon R side 1 18.7 Lung, peritoneum Y 
8 MGA R2529Kfs*9 0.124 Crohn’s 64 4 Descending colon L side 1 1.9 Peritoneum N 
9 CHEK2 A392V 0.071 Crohn’s 70 4 Sigmoid L side 0 120.3 Liver Y 
10 DNMT3A C494F 0.035 UC 36 4 Rectosigmoid L side 1 131.2 Liver Y 
11    Crohn’s 48 4 L colon L side 1 18.1 Peritoneum N 
12    Crohn’s 29 3 Sigmoid L side 1 34.0 Peritoneum, pelvis Y 
13    Crohn’s 37 2 Ileum R side 0 0.7 N/A N 
14    UC 31 4 Transverse colon R side 1 32.2 Liver Y 
15    Crohn’s 54 1 Rectal L side 0 67.0 N/A N 
16    Crohn’s 43 3 Rectal L side 1 55.0 Lymph nodes Y 
17 MDC1 R1882* 0.02 Crohn’s 35 4 Rectal L side 1 19.9 Liver, lung, bone N 
18    UC 55 4 Sigmoid L side 1 5.0 Pelvis, ovary Y 
19 ABL1 S1120L 0.043 Crohn’s 58 3 Rectal L side 1 31.0 Pelvis Y 
20    Crohn’s 57 3 Rectal L side 1 28.3 Peritoneum N 
21    Crohn’s 57 3 Small intestine Small intestine 1 56.8 Peritoneum Y 
22    Crohn’s 52 2 Ileum Small intestine 0 52.8 N/A N 
23    Crohn’s 38 2 Ileum Small intestine 0 50.8 N/A N 
24    UC 45 1 Rectal L side 0 60.3 N/A N 
25    Crohn’s 57 4 Ileum Small intestine 1 17.5 Liver N 
26 DNMT3A R742Gfs*37 0.03 Crohn’s 35 4 Rectum L side 1 13.5 Liver Y 
27    Crohn’s 38 3 Rectal L side 0 83.9 Pelvis Y 
28 DNMT3B R497Q 0.028 UC 67 3 Rectosigmoid L side 0 43.4 N/A N 
29    Crohn’s 51 3 Rectum L side 0 40.7 Lymph nodes N 
30    UC 51 3 Sigmoid L side 1 34.5 Liver Y 
31    UC 65 4 Distal transverse L side 1 44.9 Liver Y 
32    UC 52 3 Rectum L side 1 20.9 Lung, liver, bone N 
33    Crohn’s 64 2 Small intestine Small intestine 1 18.6 Bone, liver, lymph nodes, lungs N 
34    Crohn’s 43 4 Rectum L side 0 23.2 Skin Y 
35    Crohn’s 46 4 Transverse colon R side 0 32.4 Peritoneum N 
36    UC 62 4 Rectum L side 1 42.9 Liver, lymph nodes Y 
37    Crohn’s 70 2 Ileum Small intestine 0 88.6 Lung, lymph nodes Y 
38    UC 75 4 Sigmoid L side 1 8.5 Pelvis Y 
39    Crohn’s 57 3 Anal fistula Anal fistula 0 33.3 Lymph nodes Y 
40    UC 63 0 Descending colon L side 0 25.0 N/A N 
41    Crohn’s 60 4 Ileum Small intestine 1 13.4 Liver Y 
42    UC 67 1 Rectosigmoid L side 0 60.8 N/A N 
43    UC 49 1 Rectum L side 0 57.4 N/A N 
44    UC 56 3 Transverse colon, descending L side 0 20.5 N/A N 
45    Crohn’s 37 2 Cecum R side 0 21.5 N/A N 
46    Crohn’s 39 4 Cecum R side 0 9.7 Liver Y 
47    UC 36 4 Ascending colon R side 1 7.2 Liver Y 
48    UC 63 2 Descending colon L side 0 22.7 N/A Y 
49    UC 54 4 Rectum L side 0 19.5 Liver N 
50    Crohn’s 53 4 Splenic flexure L side 0 26.4 Peritoneum Y 
51    Crohn’s 38 3 Sigmoid L side 0 1.6 N/A N 
52    UC 52 4 Rectum L side 0 19.3 Lymph nodes N 
53    UC 32 4 Transverse colon R side 0 22.2 Liver N 
54 CREBBP R2344W 0.013 Crohn’s 36 3 Ascending colon R side 0 2.8 N/A N 
 SH2B3 H158P 0.023          
55    UC 50 3 Rectum L side 0 18.2 N/A N 
56    Crohn’s 43 4 Cecum R side 0 35.3 Liver Y 
57    UC 56 4 Sigmoid L side 0 19.1 Peritoneum, ovaries N 
58 DNMT3A R882H 0.015 UC 45 4 Rectum L side 0 28.9 Lymph nodes Y 
 PBRM1 R836Q 0.076          
59    UC 36 4 Sigmoid L side 1 12.2 Peritoneum N 
60    Crohn’s 64 1 Rectum L side 0 20.3 N/A N 
61    Crohn’s 49 1 Ileum Small intestine 0 5.3 N/A N 
62    Crohn’s 63 4 Cecum / terminal ileum R side 0 5.9 Liver, regional nodal, peritoneum N 
63    UC 69 CIS (0) Rectum L side 0 2.7 N/A N 
64    UC 46 4 Rectosigmoid L side 0 3.7 Peritoneum N 
65    UC 32 4 Ascending colon R side 1 14.8 Peritoneum N 
66    Crohn’s 24 4 Hepatic flexure R side 0 0.5 Lymph nodes N 
View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal