Table II.

Affinity measurements of the TK3, TK3Gln55His, and TK3Gln55Ala TCRs with HLA-B*3501 in complex with the HPVG peptide and its variants

Immobilized ligand Analyte Kd Kon Koff Kd calc 
  μM x104/Ms 1/s μM 
TK3WT B*3501-HPVGEADYFEY 2.2 ± 0.2 4.01 ± 0.22 0.085 ± 0.003 2.21 ± 0.25 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGEADYFEY 5.76 ± 0.07 1.65 ± 0.39 0.115 ± 0.004 7.345 ± 1.505 
TK3Gln55His B*3501-HPVGEADYFEY 34.66 ± 1.66 3.08 ± 0.25 0.787 ± 0.137 25.6 ± 1.42 
TK3WT B*3501-HPVAEADYFEY 4.8 ± 0.53 8.33 ± 2.35 0.2 ± 0.001 3.195 ± 0.115 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVAEADYFEY 12 ± 0.2 ND ND ND 
TK3Gln55His B*3501-HPVAEADYFEY 74.5 ± 1.4 ND ND ND 
TK3WT B*3501-HPVGDAYGFEY 189 ± 6 ND ND ND 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGDAYGFEY 179 ± 6 ND ND ND 
TK3Gln55His B*3501-HPVGDAYGFEY >200 ND ND ND 
TK3WT B*3501-HPVGQAYGFEY 52.03 ± 12.83 0.151 ± 0.042 0.076 ± 0.002 54.75 ± 14.45 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGQAYGFEY 99.6 ± 1.4 0.08 ± 0.001 0.131 ± 0.002 163.5 ± 5.5 
TK3Gln55His B*3501-HPVGQAYGFEY >200 ND ND ND 
Immobilized ligand Analyte Kd Kon Koff Kd calc 
  μM x104/Ms 1/s μM 
TK3WT B*3501-HPVGEADYFEY 2.2 ± 0.2 4.01 ± 0.22 0.085 ± 0.003 2.21 ± 0.25 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGEADYFEY 5.76 ± 0.07 1.65 ± 0.39 0.115 ± 0.004 7.345 ± 1.505 
TK3Gln55His B*3501-HPVGEADYFEY 34.66 ± 1.66 3.08 ± 0.25 0.787 ± 0.137 25.6 ± 1.42 
TK3WT B*3501-HPVAEADYFEY 4.8 ± 0.53 8.33 ± 2.35 0.2 ± 0.001 3.195 ± 0.115 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVAEADYFEY 12 ± 0.2 ND ND ND 
TK3Gln55His B*3501-HPVAEADYFEY 74.5 ± 1.4 ND ND ND 
TK3WT B*3501-HPVGDAYGFEY 189 ± 6 ND ND ND 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGDAYGFEY 179 ± 6 ND ND ND 
TK3Gln55His B*3501-HPVGDAYGFEY >200 ND ND ND 
TK3WT B*3501-HPVGQAYGFEY 52.03 ± 12.83 0.151 ± 0.042 0.076 ± 0.002 54.75 ± 14.45 
TK3Gln55Ala B*3501-HPVGQAYGFEY 99.6 ± 1.4 0.08 ± 0.001 0.131 ± 0.002 163.5 ± 5.5 
TK3Gln55His B*3501-HPVGQAYGFEY >200 ND ND ND 

Underlining indicates the variant amino acid.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal