Table V.

Amino acids in CDR fragments of ACC4 in comparison with germline residues involved in interactions

CDR Sequence Canonical form ΔBSA 
L1    
    IMTG 27QSLLDSDGKTY37 Class 4 44.61 Å2 (8.1%) 
    Germline    
    Contact D D Y   
L2    
    IMTG 55LVS56 Class 1 0 Å2 (0%) 
    Germline    
    Contact    
L3    
    IMTG 94WQGTHFPLT102 Class 1 122.56 Å2 (22.3%) 
    Germline    
    Contact GTHF L   
H1    
    IMTG 26GYTFTDYS33 Class 1 94.26 Å2 (17.2%) 
    Germline    
    Contact TDYS   
H2    
    IMTG 51INTETGEP58 Class 2 42.24 Å2 (7.5%) 
    Germline    
    Contact NTE   
H3    
    IMTG 97ARATTATELAY107  135.1 Å2 (24.6%) 
    Germline    
    Contact ATTATE   
FR2    
    Contact H35 W47 W50  105.5 Å2 (19.1%) 
FR3    
    Contact T59  4.86 Å2 (1%) 
CDR Sequence Canonical form ΔBSA 
L1    
    IMTG 27QSLLDSDGKTY37 Class 4 44.61 Å2 (8.1%) 
    Germline    
    Contact D D Y   
L2    
    IMTG 55LVS56 Class 1 0 Å2 (0%) 
    Germline    
    Contact    
L3    
    IMTG 94WQGTHFPLT102 Class 1 122.56 Å2 (22.3%) 
    Germline    
    Contact GTHF L   
H1    
    IMTG 26GYTFTDYS33 Class 1 94.26 Å2 (17.2%) 
    Germline    
    Contact TDYS   
H2    
    IMTG 51INTETGEP58 Class 2 42.24 Å2 (7.5%) 
    Germline    
    Contact NTE   
H3    
    IMTG 97ARATTATELAY107  135.1 Å2 (24.6%) 
    Germline    
    Contact ATTATE   
FR2    
    Contact H35 W47 W50  105.5 Å2 (19.1%) 
FR3    
    Contact T59  4.86 Å2 (1%) 

The CDR regions are determined according to IMGT rules. Residues that contact arginine7P are bolded. The residues that contact citrulline2P are underlined. FR, framework region.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal