Identification of natural CXCL8 by Edman degradation and mass spectrometry
| CXCL8 isoform . | NH2-terminal sequencea . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | Percentage of total amount of CXCL8b . | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| −2 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||
| CXCL8(-2–77) | E | G | A | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 7.8 | |||||||||||||||
| CXCL8(-2–77)Cit5 | E | G | A | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 0.7 | |||||||||||||||
| CXCL8(1–77) | A | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 25.9 | |||||||||||||||||
| CXCL8(1–77)Cit5 | A | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 4.1 | |||||||||||||||||
| CXCL8(2–77) | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 5.5 | ||||||||||||||||||
| CXCL8(2–77)Cit5 | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 0.7 | ||||||||||||||||||
| CXCL8(3–77) | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 1.1 | |||||||||||||||||||
| CXCL8(6–77) | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 44.1 | ||||||||||||||||||||||
| CXCL8(8–77) | K | E | L | R | X | Q | X | 9.0 | ||||||||||||||||||||||||
| CXCL8(9–77) | E | L | R | X | Q | X | 1.2 | |||||||||||||||||||||||||
| CXCL8 isoform . | NH2-terminal sequencea . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | Percentage of total amount of CXCL8b . | |||||||||||||||
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| −2 | 1 | 5 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||
| CXCL8(-2–77) | E | G | A | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 7.8 | |||||||||||||||
| CXCL8(-2–77)Cit5 | E | G | A | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 0.7 | |||||||||||||||
| CXCL8(1–77) | A | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 25.9 | |||||||||||||||||
| CXCL8(1–77)Cit5 | A | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 4.1 | |||||||||||||||||
| CXCL8(2–77) | V | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 5.5 | ||||||||||||||||||
| CXCL8(2–77)Cit5 | V | L | P | B | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 0.7 | ||||||||||||||||||
| CXCL8(3–77) | L | P | R | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 1.1 | |||||||||||||||||||
| CXCL8(6–77) | S | A | K | E | L | R | X | Q | X | 44.1 | ||||||||||||||||||||||
| CXCL8(8–77) | K | E | L | R | X | Q | X | 9.0 | ||||||||||||||||||||||||
| CXCL8(9–77) | E | L | R | X | Q | X | 1.2 | |||||||||||||||||||||||||
X stands for an unidentified residue (on Cys positions) and B stands for citrulline. Numbering corresponds to the position of the amino acids in CXCL8(1-77).
The relative amount of the different CXCL8 isoforms was obtained from the yields for the different amino acids during Edman degradation on >20 RP-HPLC fractions from a large batch of leukocytes from pooled blood donations (Table S1).