Table I.

Frequency of clone selection in genomic library screens

ORF
Common name
Screens
Hits
FhuA
LamB
IgG
IgA
P
H
SP2216 PcsB, secreted 45-kD protein (Usp45) 12 1766 1606 160 1374 392 662 1104 
SP2190 PspC/CbpA 12 642 71 571 343 299 402 240 
SP0117 PspA 12 272 75 197 158 114 183 89 
SP0641 Serine protease, subtilase family 11 525 237 288 475 50 271 254 
SP0664 Zinc metalloprotease ZmpB, putative 11 253 145 108 158 95 184 69 
SP0071 IgA1 protease (Iga1) 10 164 26 138 70 94 105 59 
SP1154 IgA1 protease (Iga2) 10 61 26 35 46 15 21 40 
SP1174 Conserved domain protein 9 86 71 15 75 11 54 32 
SP1527 Oligopeptide ABC transporter 9 64 7 57 37 27 4 60 
SP1693 NanA 9 47 12 35 15 32 33 14 
SP2201 CbpD 9 46 16 30 18 28 36 10 
SP1004 Conserved hypothetical protein 9 43 38 5 29 14 26 17 
SP1772 Cell wall surface anchor family protein 9 32 24 8 30 2 17 15 
SP2136 PcpA 8 302 4 298 101 201 230 72 
SP2099 Pbp1B 8 34 29 5 31 3 9 25 
SP1175 Conserved domain protein 8 28 22 6 24 4 18 10 
SP0107 LysM domain protein 7 219 218 1 215 4 185 34 
SP1573 Lysozyme (LytC) 7 111 99 12 57 54 9 102 
SP1003 Conserved hypothetical protein 7 38 36 2 31 7 23 15 
SP0648 β-galactosidase (BgaA) 7 11 3 8 10 1 4 7 
SP0667 Pneumococcal surface protein, putative 6 327 327 0 235 92 85 242 
SP0082 Cell wall surface anchor family protein 6 112 15 97 112 0 77 35 
SP0377 CbpC 6 109 0 109 16 93 99 10 
SP2027 Conserved hypothetical protein 6 54 2 52 34 20 6 48 
SP0069 Choline-binding protein I (CbpI) 6 52 0 52 7 45 48 4 
SP1891 Oligopeptide ABC transporter 6 28 7 21 13 15 2 26 
SP1937 Autolysin (LytA) 6 19 4 15 4 15 16 3 
SP0057 β-N-acetylhexosaminidase (StrH) 6 7 4 3 5 2 3 4 
ORF
Common name
Screens
Hits
FhuA
LamB
IgG
IgA
P
H
SP2216 PcsB, secreted 45-kD protein (Usp45) 12 1766 1606 160 1374 392 662 1104 
SP2190 PspC/CbpA 12 642 71 571 343 299 402 240 
SP0117 PspA 12 272 75 197 158 114 183 89 
SP0641 Serine protease, subtilase family 11 525 237 288 475 50 271 254 
SP0664 Zinc metalloprotease ZmpB, putative 11 253 145 108 158 95 184 69 
SP0071 IgA1 protease (Iga1) 10 164 26 138 70 94 105 59 
SP1154 IgA1 protease (Iga2) 10 61 26 35 46 15 21 40 
SP1174 Conserved domain protein 9 86 71 15 75 11 54 32 
SP1527 Oligopeptide ABC transporter 9 64 7 57 37 27 4 60 
SP1693 NanA 9 47 12 35 15 32 33 14 
SP2201 CbpD 9 46 16 30 18 28 36 10 
SP1004 Conserved hypothetical protein 9 43 38 5 29 14 26 17 
SP1772 Cell wall surface anchor family protein 9 32 24 8 30 2 17 15 
SP2136 PcpA 8 302 4 298 101 201 230 72 
SP2099 Pbp1B 8 34 29 5 31 3 9 25 
SP1175 Conserved domain protein 8 28 22 6 24 4 18 10 
SP0107 LysM domain protein 7 219 218 1 215 4 185 34 
SP1573 Lysozyme (LytC) 7 111 99 12 57 54 9 102 
SP1003 Conserved hypothetical protein 7 38 36 2 31 7 23 15 
SP0648 β-galactosidase (BgaA) 7 11 3 8 10 1 4 7 
SP0667 Pneumococcal surface protein, putative 6 327 327 0 235 92 85 242 
SP0082 Cell wall surface anchor family protein 6 112 15 97 112 0 77 35 
SP0377 CbpC 6 109 0 109 16 93 99 10 
SP2027 Conserved hypothetical protein 6 54 2 52 34 20 6 48 
SP0069 Choline-binding protein I (CbpI) 6 52 0 52 7 45 48 4 
SP1891 Oligopeptide ABC transporter 6 28 7 21 13 15 2 26 
SP1937 Autolysin (LytA) 6 19 4 15 4 15 16 3 
SP0057 β-N-acetylhexosaminidase (StrH) 6 7 4 3 5 2 3 4 

Screens represent the number of screens in which a given antigen was selected. Hits describe the total number of E. coli clones selected for one ORF; FhuA and LamB describe the total number of E. coli clones selected from the FhuA or LamB library, respectively; IgG and IgA describe the total number of E. coli clones selected with IgGs or IgAs; and P and H describe the total number of E. coli clones selected with antibodies derived from patients or healthy adult donors, respectively.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal