Table III.

Spectrum of mutations observed in Canr colonies from day 7

Clone
Mutation type
Position from ATG
Sequence
Wild typea      
    1 Base substitution C→T Proline-leucine 656 TGTTCCCTGTC 
    2 Base substitution T→G Asparagine-lysine 1173 AAATTCAAATA 
 Insertion G  1710 GAGGC-G-AATTGT 
    3 Duplication  248bp 184–431  
    4 Base substitution G→C Alanine-proline 709 TTTTAGCCATTA 
 Deletion TG Isoleucine-arginineframeshift 1098–1099 TTGCTATTGAGAA 
    5 Base substitution G→T Glycine-valine 353 ACGCCGGCCCAG 
 Insertion A  1341 CAAA-A-GTTTTCG 
    6 Base substitution C→T Proline-serine 937 GCTGCAAACCCCA 
    7 no PCR     
    8 Deletion AT Frameshift 1129–1130 TGTCACATATCTT 
 Insertion T Frameshift (T3-T4) 1086 CCCTTT-T-ATTATT 
    9 Base substitution G→T Tryptophan-cysteine 531 GGTTTTCTTGGCA 
 Deletion A Frame-shift (A3-A2) 663 CAAATATTACGGT 
 Insertion T Frameshift (T3-T4) 1086 CCCTTT-T-ATTATT 
    10 Base substitution G→A Glutamic acid-lysine 679 GAATTCGAGTTCT 
 Base substitution G→T Valine-phenylalanine 907 GAACTATTTGGTA 
 Deletion A Frameshift 1217 TATCAAAGAACAC 
sgs1Δb      
    1 Base substitution C→A Tyrosine-STOP 591 GGACGTACAAAG 
 Deletion A Frameshift (A6-A5) 969 TCAAAAAAGTTGC 
    2 Deletion T Frameshift 1756 GAATGTTGTAGC 
    3     partially sequenced     
    4 no PCR     
    5 Base substitution T→C Valine-alanine 659 GTTCCCTGTCAAA 
    6 no PCR     
    7     partially sequenced     
    8 no PCR     
    9 Base substitution T→C Tryptophan-arginine 529 GGTTTTCTTGGGC 
    10 Base substitution C→A Alanine-aspartic acid 1166 ATTTCTGCCGCAA 
sch9Δsgs1Δc      
    1 Insertion CT Frameshift 1006–1007 GCTCTCT-CT-ATT 
    2 Base substitution G→A Glycine-serine 670 ATTACGGTGAATT 
    3 Base substitution G→T Glutamic acid-STOP 184 TGGCGAGGATAC 
    4     partially sequenced     
    5 no PCR     
    6 Base substitution A→C Tyrosine-serine 1184 TATTTACGTTGGT 
    7 Base substitution G→T Glycine-valine 911 TAGTTGGTATCAC 
    8 Base substitution G→A Glycine-serine 922 ACTGCTGGTGAAG 
    9 Base substitution C→A Phenylalan-leucine 1193 ACGTTGGTTCCTA 
    10 Deletion T Frameshift leucine-phenyalan 543 AATCACTTTTGCC 
 Base substitution G→C No change 544 AATCACTTTTGCC 
Clone
Mutation type
Position from ATG
Sequence
Wild typea      
    1 Base substitution C→T Proline-leucine 656 TGTTCCCTGTC 
    2 Base substitution T→G Asparagine-lysine 1173 AAATTCAAATA 
 Insertion G  1710 GAGGC-G-AATTGT 
    3 Duplication  248bp 184–431  
    4 Base substitution G→C Alanine-proline 709 TTTTAGCCATTA 
 Deletion TG Isoleucine-arginineframeshift 1098–1099 TTGCTATTGAGAA 
    5 Base substitution G→T Glycine-valine 353 ACGCCGGCCCAG 
 Insertion A  1341 CAAA-A-GTTTTCG 
    6 Base substitution C→T Proline-serine 937 GCTGCAAACCCCA 
    7 no PCR     
    8 Deletion AT Frameshift 1129–1130 TGTCACATATCTT 
 Insertion T Frameshift (T3-T4) 1086 CCCTTT-T-ATTATT 
    9 Base substitution G→T Tryptophan-cysteine 531 GGTTTTCTTGGCA 
 Deletion A Frame-shift (A3-A2) 663 CAAATATTACGGT 
 Insertion T Frameshift (T3-T4) 1086 CCCTTT-T-ATTATT 
    10 Base substitution G→A Glutamic acid-lysine 679 GAATTCGAGTTCT 
 Base substitution G→T Valine-phenylalanine 907 GAACTATTTGGTA 
 Deletion A Frameshift 1217 TATCAAAGAACAC 
sgs1Δb      
    1 Base substitution C→A Tyrosine-STOP 591 GGACGTACAAAG 
 Deletion A Frameshift (A6-A5) 969 TCAAAAAAGTTGC 
    2 Deletion T Frameshift 1756 GAATGTTGTAGC 
    3     partially sequenced     
    4 no PCR     
    5 Base substitution T→C Valine-alanine 659 GTTCCCTGTCAAA 
    6 no PCR     
    7     partially sequenced     
    8 no PCR     
    9 Base substitution T→C Tryptophan-arginine 529 GGTTTTCTTGGGC 
    10 Base substitution C→A Alanine-aspartic acid 1166 ATTTCTGCCGCAA 
sch9Δsgs1Δc      
    1 Insertion CT Frameshift 1006–1007 GCTCTCT-CT-ATT 
    2 Base substitution G→A Glycine-serine 670 ATTACGGTGAATT 
    3 Base substitution G→T Glutamic acid-STOP 184 TGGCGAGGATAC 
    4     partially sequenced     
    5 no PCR     
    6 Base substitution A→C Tyrosine-serine 1184 TATTTACGTTGGT 
    7 Base substitution G→T Glycine-valine 911 TAGTTGGTATCAC 
    8 Base substitution G→A Glycine-serine 922 ACTGCTGGTGAAG 
    9 Base substitution C→A Phenylalan-leucine 1193 ACGTTGGTTCCTA 
    10 Deletion T Frameshift leucine-phenyalan 543 AATCACTTTTGCC 
 Base substitution G→C No change 544 AATCACTTTTGCC 

Base substitutions: bold, insertions; underline, deletions.

a

Total clones: 10 (no PCR, 1/10; sequenced, 9/10).

b

Total clones: 10 (no PCR, 3/10; partially sequenced, 2/10; sequenced, 5/10).

c

Total clones: 10 (no PCR, 1/10; partially sequenced, 1/10; sequenced, 8/10).

[ViewLarge]
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal