Table I.

Transport velocities of GFP tagged IFT proteins in wild-type and nephrocystin mutant animals

Reporters
Genotype
Middle segment
Distal segment
Mean velocity (μm/s)
n
t test
f-test
Mean velocity (μm/s)
n
Kinesin-2 motors        
    KAP-1∷GFP Wild type 0.69 ± 0.09 446   None  
 nphp-1 0.69 ± 0.09 420 0.49 0.4 None  
 nphp-4 0.68 ± 0.09 375 0.66 0.93 None  
 nphp-1;nphp-4 0.68 ± 0.09 423 0.77 0.46 None  
    OSM-3∷GFP Wild type 0.72 ± 0.07 128   1.22 ± 0.14 145 
 nphp-1 0.72 ± 0.07 81 0.9 0.37 1.18 ± 0.15 76 
 nphp-4 0.83 ± 0.15 101 <0.001 <0.001 1.16 ± 0.14 55 
 nphp-1;nphp-4 0.81 ± 0.15 213 <0.001 <0.001 1.03 ± 0.14 124 
IFT particle A        
    CHE-11∷GFP Wild type 0.71 ± 0.09 119   1.13 ± 0.15 119 
 nphp-1 0.72 ± 0.08 131 0.9 0.22 1.19 ± 0.15 95 
 nphp-4 0.74 ± 0.14 252 0.09 <0.001 1.11 ± 0.16 144 
 nphp-1;nphp-4 0.74 ± 0.13 350 0.04 <0.001 1.06 ± 0.18 125 
IFT particle B        
    OSM-6∷GFP Wild type 0.71 ± 0.08 219   1.14 ± 0.16 218 
 nphp-1 0.70 ± 0.09 98 0.48 0.25 1.26 ± 0.14 98 
 nphp-4 0.49 ± 0.06 132 <0.001 0.02 1.07 ± 0.17 104 
 nphp-1;nphp-4 0.47 ± 0.07 57 <0.001 0.2 ND - 
 nphp-4;kap-1 None - - - None - 
 kap-1 bbs-7;nphp-4 None - - - None - 
 osm-3 0.50 ± 0.07 252 <0.001 0.22 None - 
 osm-3;nphp-4 0.51 ± 0.06 221 <0.001 0.006 None - 
    OSM-5∷GFP Wild type 0.71 ± 0.06 125   1.06 ± 0.16 132 
 nphp-1 0.72 ± 0.08 281 0.567 0.004 1.07 ± 0.12 163 
 nphp-4 0.75 ± 0.13 336 <0.001 <0.001 1.03 ± 0.14 132 
 nphp-1;nphp-4 0.76 ± 0.15 472 <0.001 <0.001 1.05 ± 0.13 233 
DYF proteins        
    DYF-1∷GFP Wild type 0.72 ± 0.08 194   1.18 ± 0.14 139 
 nphp-1 0.70 ± 0.09 83 0.17 0.15 1.07 ± 0.16 84 
 nphp-4 0.77 ± 0.16 107 <0.001 <0.001 1.06 ± 0.16 80 
 nphp-1;nphp-4 0.76 ± 0.16 167 <0.001 <0.001 1.04 ± 0.16 130 
BBS proteins        
    BBS-7∷GFP Wild type 0.68 ± 0.08 23   1.14 ± 0.16 56 
 nphp-1 0.70 ± 0.07 110 0.19 0.63 1.15 ± 0.16 148 
 nphp-4 0.82 ± 0.19 100 <0.001 <0.001 1.01 ± 0.23 56 
 nphp-1;nphp-4 0.78 ± 0.17 66 <0.001 <0.001 1.02 ± 0.14 31 
Reporters
Genotype
Middle segment
Distal segment
Mean velocity (μm/s)
n
t test
f-test
Mean velocity (μm/s)
n
Kinesin-2 motors        
    KAP-1∷GFP Wild type 0.69 ± 0.09 446   None  
 nphp-1 0.69 ± 0.09 420 0.49 0.4 None  
 nphp-4 0.68 ± 0.09 375 0.66 0.93 None  
 nphp-1;nphp-4 0.68 ± 0.09 423 0.77 0.46 None  
    OSM-3∷GFP Wild type 0.72 ± 0.07 128   1.22 ± 0.14 145 
 nphp-1 0.72 ± 0.07 81 0.9 0.37 1.18 ± 0.15 76 
 nphp-4 0.83 ± 0.15 101 <0.001 <0.001 1.16 ± 0.14 55 
 nphp-1;nphp-4 0.81 ± 0.15 213 <0.001 <0.001 1.03 ± 0.14 124 
IFT particle A        
    CHE-11∷GFP Wild type 0.71 ± 0.09 119   1.13 ± 0.15 119 
 nphp-1 0.72 ± 0.08 131 0.9 0.22 1.19 ± 0.15 95 
 nphp-4 0.74 ± 0.14 252 0.09 <0.001 1.11 ± 0.16 144 
 nphp-1;nphp-4 0.74 ± 0.13 350 0.04 <0.001 1.06 ± 0.18 125 
IFT particle B        
    OSM-6∷GFP Wild type 0.71 ± 0.08 219   1.14 ± 0.16 218 
 nphp-1 0.70 ± 0.09 98 0.48 0.25 1.26 ± 0.14 98 
 nphp-4 0.49 ± 0.06 132 <0.001 0.02 1.07 ± 0.17 104 
 nphp-1;nphp-4 0.47 ± 0.07 57 <0.001 0.2 ND - 
 nphp-4;kap-1 None - - - None - 
 kap-1 bbs-7;nphp-4 None - - - None - 
 osm-3 0.50 ± 0.07 252 <0.001 0.22 None - 
 osm-3;nphp-4 0.51 ± 0.06 221 <0.001 0.006 None - 
    OSM-5∷GFP Wild type 0.71 ± 0.06 125   1.06 ± 0.16 132 
 nphp-1 0.72 ± 0.08 281 0.567 0.004 1.07 ± 0.12 163 
 nphp-4 0.75 ± 0.13 336 <0.001 <0.001 1.03 ± 0.14 132 
 nphp-1;nphp-4 0.76 ± 0.15 472 <0.001 <0.001 1.05 ± 0.13 233 
DYF proteins        
    DYF-1∷GFP Wild type 0.72 ± 0.08 194   1.18 ± 0.14 139 
 nphp-1 0.70 ± 0.09 83 0.17 0.15 1.07 ± 0.16 84 
 nphp-4 0.77 ± 0.16 107 <0.001 <0.001 1.06 ± 0.16 80 
 nphp-1;nphp-4 0.76 ± 0.16 167 <0.001 <0.001 1.04 ± 0.16 130 
BBS proteins        
    BBS-7∷GFP Wild type 0.68 ± 0.08 23   1.14 ± 0.16 56 
 nphp-1 0.70 ± 0.07 110 0.19 0.63 1.15 ± 0.16 148 
 nphp-4 0.82 ± 0.19 100 <0.001 <0.001 1.01 ± 0.23 56 
 nphp-1;nphp-4 0.78 ± 0.17 66 <0.001 <0.001 1.02 ± 0.14 31 

IFT velocities in wild type and nephrocystin mutants. The velocities of many IFT components are altered in nphp-4 and nphp-1;nphp-4 but not nphp-1 animals. Distal segment velocities were similar to the wild type except for the slow OSM-6∷GFP rates. Mean difference was shown statistically by a t test, whereas statistical variance difference was shown by an analysis of variance test f-test.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal