Table 2.
Primers used for gene expression profiling
NameSequence (5′-3′)
ABCB1-F CTTCAGGGTTTCACATTTGGC 
ABCB1-R GGTAGTCAATGCTCCAGTGG 
ABCC1-F ACTTCGTTCTCAGGCACATC 
ABCC1-R TGATCCGAAATAAGCCCAGG 
ABCC2-F TCATCGTCATTCCTCTTGGC 
ABCC2-R ACGGATAACTGGCAAACCTG 
ABCC3-F ACCTGTCCAAGCTCAAGATG 
ABCC3-R GGGTGACAAAGAAAACAGGG 
ABCC5-F CAGAGACCGTGAAGATTCCAAG 
ABCC5-R TGAGCTGAGAATGCATGGAG 
ATP7A-F TTGGAAAAGTGAATGGTGTGC 
ATP7A-R GATAACAGCATCAAAGCCCATG 
ATP7B-F GCTCTTTGTGTTCATTGCCC 
ATP7B-R GAGACATGAGTTTAGCCAGGG 
MTF1-F CTTCCTTACCTCTTACAGCCTC 
MTF1-R TGTGAAGCCTCTGATGTGC 
SLC31A1-F GACGGGTTAAGATTCGGAGAG 
SLC31A1-R AGGTTGCATGGTACTGTTGG 
VDAC1-F CCTTCGATTCATCCTTCTCACC 
VDAC1-R GTAACCTAGCACCAGAGCAC 
GSTA3-F AAGTCGCTATTTCCCTGCC 
GSTA3-R GAAGTTGGAGATAAGGCTGGAG 
GSS-F AGCGTGCCATAGAGAATGAG 
GSS-R ATCCCGGAAGTAAACCACAG 
RPA-F CTATAATGAAGGACTCGGGCAG 
RPA-R GTCTTTGAAGCACCATAAGCC 
MGMT-F GCTGAATGCCTATTTCCACC 
MGMT-R CACTTCTCCGAATTTCACAACC 
TP53-F GCCATCTACAAGCAGTCACAG 
TP53-R TCATCCAAATACTCCACACGC 
CDKN1A-F TGTCACTGTCTTGTACCCTTG 
CDKN1A-R GGCGTTTGGAGTGGTAGAA 
APAF1-F GGCTGTGGGAAGTCTGTATTAG 
APAF1-R CAACCGTGTGCAAAGATTCTG 
E2F1-F TCTCCGAGGACACTGACAG 
E2F1-R ATCACCATAACCATCTGCTCTG 
ATM-F ATTCCGACTTTGTTCCCTCTG 
ATM-R CATCTTGGTCCCCATTCTAGC 
FANCD2-F GGAGTCCATGTCTGCTAAAGAG 
FANCD2-R CAATGTGCTTTAACCGAGTGAG 
ATR-F CCTTGAACATGAAAGCCTTGG 
ATR-R CCTGAGTGATAACAGTAGACAGC 
RAD51-F GTGGTAGCTCAAGTGGATGG 
RAD51-R GGGAGAGTCGTAGATTTTGCAG 
POLH-F CTACTCGGGAACAGGTACAATG 
POLH-R ACACGAATGCTCACAACCAG 
RECQL-F AGTTCAGACCACTTCAGCTTG 
RECQL-R GGGCAAATGACGAGTGTAAAAC 
MSH2-F AAAGGGAGAGCAGATGAATAGTG 
MSH2-R TGATTACCGCAGACAGTGATG 
BRCA2-F TTCATGGAGCAGAACTGGTG 
BRCA2-R AGGAAAAGGTCTAGGGTCAGG 
ERCC1-F AATTTGTGATACCCCTCGACG 
ERCC1-R TGTGAGATGGCATATTCGGC 
BRCA1-F GCCTTCTAACAGCTACCCTTC 
BRCA1-R CTTCTGGATTCTGGCTTATAGGG 
CHAF1A-F GAGGATGAAGATGAGGACGATG 
CHAF1A-R TCCTTGGCCTTCAGTTTCTG 
MLH1-F GGCACAGCATCAAACCAAG 
MLH1-R CAAGCATGGCAAGGTCAAAG 
RBBP8-F GAAATTGGCTTCCTGCTCAAG 
RBBP8-R TTTTGGACGAGGACAAGGATC 
NameSequence (5′-3′)
ABCB1-F CTTCAGGGTTTCACATTTGGC 
ABCB1-R GGTAGTCAATGCTCCAGTGG 
ABCC1-F ACTTCGTTCTCAGGCACATC 
ABCC1-R TGATCCGAAATAAGCCCAGG 
ABCC2-F TCATCGTCATTCCTCTTGGC 
ABCC2-R ACGGATAACTGGCAAACCTG 
ABCC3-F ACCTGTCCAAGCTCAAGATG 
ABCC3-R GGGTGACAAAGAAAACAGGG 
ABCC5-F CAGAGACCGTGAAGATTCCAAG 
ABCC5-R TGAGCTGAGAATGCATGGAG 
ATP7A-F TTGGAAAAGTGAATGGTGTGC 
ATP7A-R GATAACAGCATCAAAGCCCATG 
ATP7B-F GCTCTTTGTGTTCATTGCCC 
ATP7B-R GAGACATGAGTTTAGCCAGGG 
MTF1-F CTTCCTTACCTCTTACAGCCTC 
MTF1-R TGTGAAGCCTCTGATGTGC 
SLC31A1-F GACGGGTTAAGATTCGGAGAG 
SLC31A1-R AGGTTGCATGGTACTGTTGG 
VDAC1-F CCTTCGATTCATCCTTCTCACC 
VDAC1-R GTAACCTAGCACCAGAGCAC 
GSTA3-F AAGTCGCTATTTCCCTGCC 
GSTA3-R GAAGTTGGAGATAAGGCTGGAG 
GSS-F AGCGTGCCATAGAGAATGAG 
GSS-R ATCCCGGAAGTAAACCACAG 
RPA-F CTATAATGAAGGACTCGGGCAG 
RPA-R GTCTTTGAAGCACCATAAGCC 
MGMT-F GCTGAATGCCTATTTCCACC 
MGMT-R CACTTCTCCGAATTTCACAACC 
TP53-F GCCATCTACAAGCAGTCACAG 
TP53-R TCATCCAAATACTCCACACGC 
CDKN1A-F TGTCACTGTCTTGTACCCTTG 
CDKN1A-R GGCGTTTGGAGTGGTAGAA 
APAF1-F GGCTGTGGGAAGTCTGTATTAG 
APAF1-R CAACCGTGTGCAAAGATTCTG 
E2F1-F TCTCCGAGGACACTGACAG 
E2F1-R ATCACCATAACCATCTGCTCTG 
ATM-F ATTCCGACTTTGTTCCCTCTG 
ATM-R CATCTTGGTCCCCATTCTAGC 
FANCD2-F GGAGTCCATGTCTGCTAAAGAG 
FANCD2-R CAATGTGCTTTAACCGAGTGAG 
ATR-F CCTTGAACATGAAAGCCTTGG 
ATR-R CCTGAGTGATAACAGTAGACAGC 
RAD51-F GTGGTAGCTCAAGTGGATGG 
RAD51-R GGGAGAGTCGTAGATTTTGCAG 
POLH-F CTACTCGGGAACAGGTACAATG 
POLH-R ACACGAATGCTCACAACCAG 
RECQL-F AGTTCAGACCACTTCAGCTTG 
RECQL-R GGGCAAATGACGAGTGTAAAAC 
MSH2-F AAAGGGAGAGCAGATGAATAGTG 
MSH2-R TGATTACCGCAGACAGTGATG 
BRCA2-F TTCATGGAGCAGAACTGGTG 
BRCA2-R AGGAAAAGGTCTAGGGTCAGG 
ERCC1-F AATTTGTGATACCCCTCGACG 
ERCC1-R TGTGAGATGGCATATTCGGC 
BRCA1-F GCCTTCTAACAGCTACCCTTC 
BRCA1-R CTTCTGGATTCTGGCTTATAGGG 
CHAF1A-F GAGGATGAAGATGAGGACGATG 
CHAF1A-R TCCTTGGCCTTCAGTTTCTG 
MLH1-F GGCACAGCATCAAACCAAG 
MLH1-R CAAGCATGGCAAGGTCAAAG 
RBBP8-F GAAATTGGCTTCCTGCTCAAG 
RBBP8-R TTTTGGACGAGGACAAGGATC 

or Create an Account

Close Modal
Close Modal