Table 1.

Protein sequences of mouse editor, human potential editor and human non-editor light chains analyzed in this study

Name FW1 CDR1 FW2 CDR2 FW3 CDR3 
Mouse editor light chains      
VκBt20 STTVTQSPASLSMAIGEKVTIRC ITSTDIDD------DMN WYQQKPGEPPKLLIS EGNTLRP----- GVPSRFSSSGYGTDFVFTIENMLSEDVADYYCL QSDNLP---- 
VκBw20 ETTVTQSPASLSVATGEKVTIRC ITSTDIDD------DMN WYQQKPGEPPKLLIS EGNTLRP----- GVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCL QSDNMP---- 
Vκ21-4 DIVLTQSPASLAVSLGQRATISC KASQS-VDYD-GDSYMN WYQQKPGQPPKLLIY AASNLES----- GIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQ QSNEDP---- 
Vκ12-46 DIQMTQSPASLSVSVGETVTITC RASENIYS------NLA WYQQKQGKSPQLLVY AATNLAD----- GVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQSEDFGSYYCQ HFWGTP---- 
VκGj38c DIQMTQSPSSLSASLGGKVTITC KASQDINK------YIA WYQHKPGKGPRLLIH YTSTLQP----- GIPSRFSGSGSGRDYSFSISNLEPEDIATYYCL QYDNLL---- 
VλX QLVLTQSS-SASFSLGASAKLTC TLSSQHST-----YTIE WYQQQPLKPPKYVME LKKDGSH-STGD GIPDRFSGSSSGADRYLSISNIQPEDEAIYIC GVGDTIKEQFV 
Human potential editor light chains      
VκO8/O18 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC QASQDISN------YLN WYQQKPGKAPKLLIY DASNLET----- GVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYC QQYDNLP---- 
VκL11 AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC LQDYNYP---- 
VκO2/O12 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQSISS------YLN WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQSYSTP---- 
Vλ5-1 LPVLTQPPSASALLGASIKLTCT LSSEHST------YTIE WYQQRPGRSPQYIMK VKSDGSH-SKGD GIPDRFMGSSSGADRYLTFSNLQSDDEAEYHC GESHTIDGQVG 
Vλ5-2 QPVLTQPPSASASLGASVTLTCT LSSGYSN------YKVD WYQQRPGKGPRFVMR VGTGGIVGSKGD GIPDRFSVLGSGLNRYLTIKNIQEEDESDYHC GADHGSGSNFV 
Vλ5-4 QPVLTQSSSASASLGSSVKLTCT LSSGHSS------YIIA WHQQQPGKAPRYLMK LEGSGSY-NKGS GVPDRFSGSSSGADRYLTISNLQFEDEADYYC ETWDSNT---- 
Vλ5-6 QLVLTQSPSASASLGASVKLTCT LSSGHSS------YAIA WHQQQPEKGPRYLMK LNSDGSH-SKGD GIPDRFSGSSSGAERYLTISSLQSEDEADYYC QTWGTG----- 
Human non-editor light chains      
VκA2 DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC KSSQSLLHSD-GKTYLY WYLQKPGQPPQLLIY EVSNRFS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQSIQLP---- 
VκA17 DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISC RSSQSLVYSD-GNTYLN WFQQRPGQSPRRLIY KVSNRDS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQGTHWP---- 
VκA19 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLHSN-GYNYLD WYLQKPGQSPQLLIY LGSNRAS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQALQTP---- 
VκA20 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WYQQKPGKVPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYC QKYNSAP---- 
VκA23 DIVMTQTPLSSPVTLGQPASISC RSSQSLVHSD-GNTYLS WLQQRPGQPPRLLIY KISNRFS----- GVPDRFSGSGAGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQATQFP---- 
VκA26 EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC RASQSIGSS------LH WYQQKPDQSPKLLIK YASQSFS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC HQSSSLP---- 
VκA27 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC RASQSVSSS-----YLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT----- GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSP---- 
VκA30 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKRLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC LQHNSYP---- 
VκB3 DIVMTQSPDSLAVSLGERATINC KSSQSVLYSSNNKNYLA WYQQKPGQPPKLLIY WASTRES----- GVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYC QQYYSTP---- 
VκL1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WFQQKPGKAPKSLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP---- 
VκL2 EIVMTQSPATLSVSPGERATLSC RASQSVSSN------LA WYQQKPGQAPRLLIY GASTRAT----- GIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYC QQYNNWP---- 
VκL5 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP---- 
VκL6 EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC RASQSVSS------YLA WYQQKPGQAPRLLIY DASNRAT----- GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYC QQRSNWP---- 
VκL8 DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP---- 
VκL9 AIRMTQSPSSFSASTGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP---- 
VκL12a DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY KASSLES----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYC QQYNSYSP--- 
VκL4/18a AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISS------ALA WYQQKPGKAPKLLIY DASSLES----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQFNSYP---- 
L23 AIRMTQSPFSLSASVGDRVTITC WASQGISS------YLA WYQQKPAKAPKLFIY YASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYC QQYYSTP---- 
L24 VIWMTQSPSLLSASTGDRVTISC RMSQGISS------YLA WYQQKPGKAPELLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISCLQSEDFATYYC QQYYSFP---- 
Name FW1 CDR1 FW2 CDR2 FW3 CDR3 
Mouse editor light chains      
VκBt20 STTVTQSPASLSMAIGEKVTIRC ITSTDIDD------DMN WYQQKPGEPPKLLIS EGNTLRP----- GVPSRFSSSGYGTDFVFTIENMLSEDVADYYCL QSDNLP---- 
VκBw20 ETTVTQSPASLSVATGEKVTIRC ITSTDIDD------DMN WYQQKPGEPPKLLIS EGNTLRP----- GVPSRFSSSGYGTDFVFTIENTLSEDVADYYCL QSDNMP---- 
Vκ21-4 DIVLTQSPASLAVSLGQRATISC KASQS-VDYD-GDSYMN WYQQKPGQPPKLLIY AASNLES----- GIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQ QSNEDP---- 
Vκ12-46 DIQMTQSPASLSVSVGETVTITC RASENIYS------NLA WYQQKQGKSPQLLVY AATNLAD----- GVPSRFSGSGSGTQYSLKINSLQSEDFGSYYCQ HFWGTP---- 
VκGj38c DIQMTQSPSSLSASLGGKVTITC KASQDINK------YIA WYQHKPGKGPRLLIH YTSTLQP----- GIPSRFSGSGSGRDYSFSISNLEPEDIATYYCL QYDNLL---- 
VλX QLVLTQSS-SASFSLGASAKLTC TLSSQHST-----YTIE WYQQQPLKPPKYVME LKKDGSH-STGD GIPDRFSGSSSGADRYLSISNIQPEDEAIYIC GVGDTIKEQFV 
Human potential editor light chains      
VκO8/O18 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC QASQDISN------YLN WYQQKPGKAPKLLIY DASNLET----- GVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYC QQYDNLP---- 
VκL11 AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC LQDYNYP---- 
VκO2/O12 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQSISS------YLN WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQSYSTP---- 
Vλ5-1 LPVLTQPPSASALLGASIKLTCT LSSEHST------YTIE WYQQRPGRSPQYIMK VKSDGSH-SKGD GIPDRFMGSSSGADRYLTFSNLQSDDEAEYHC GESHTIDGQVG 
Vλ5-2 QPVLTQPPSASASLGASVTLTCT LSSGYSN------YKVD WYQQRPGKGPRFVMR VGTGGIVGSKGD GIPDRFSVLGSGLNRYLTIKNIQEEDESDYHC GADHGSGSNFV 
Vλ5-4 QPVLTQSSSASASLGSSVKLTCT LSSGHSS------YIIA WHQQQPGKAPRYLMK LEGSGSY-NKGS GVPDRFSGSSSGADRYLTISNLQFEDEADYYC ETWDSNT---- 
Vλ5-6 QLVLTQSPSASASLGASVKLTCT LSSGHSS------YAIA WHQQQPEKGPRYLMK LNSDGSH-SKGD GIPDRFSGSSSGAERYLTISSLQSEDEADYYC QTWGTG----- 
Human non-editor light chains      
VκA2 DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC KSSQSLLHSD-GKTYLY WYLQKPGQPPQLLIY EVSNRFS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQSIQLP---- 
VκA17 DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISC RSSQSLVYSD-GNTYLN WFQQRPGQSPRRLIY KVSNRDS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQGTHWP---- 
VκA19 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLHSN-GYNYLD WYLQKPGQSPQLLIY LGSNRAS----- GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQALQTP---- 
VκA20 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WYQQKPGKVPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYC QKYNSAP---- 
VκA23 DIVMTQTPLSSPVTLGQPASISC RSSQSLVHSD-GNTYLS WLQQRPGQPPRLLIY KISNRFS----- GVPDRFSGSGAGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQATQFP---- 
VκA26 EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC RASQSIGSS------LH WYQQKPDQSPKLLIK YASQSFS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC HQSSSLP---- 
VκA27 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC RASQSVSSS-----YLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT----- GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSP---- 
VκA30 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKRLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC LQHNSYP---- 
VκB3 DIVMTQSPDSLAVSLGERATINC KSSQSVLYSSNNKNYLA WYQQKPGQPPKLLIY WASTRES----- GVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYC QQYYSTP---- 
VκL1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WFQQKPGKAPKSLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP---- 
VκL2 EIVMTQSPATLSVSPGERATLSC RASQSVSSN------LA WYQQKPGQAPRLLIY GASTRAT----- GIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYC QQYNNWP---- 
VκL5 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP---- 
VκL6 EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC RASQSVSS------YLA WYQQKPGQAPRLLIY DASNRAT----- GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYC QQRSNWP---- 
VκL8 DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP---- 
VκL9 AIRMTQSPSSFSASTGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP---- 
VκL12a DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY KASSLES----- GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYC QQYNSYSP--- 
VκL4/18a AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISS------ALA WYQQKPGKAPKLLIY DASSLES----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQFNSYP---- 
L23 AIRMTQSPFSLSASVGDRVTITC WASQGISS------YLA WYQQKPAKAPKLFIY YASSLQS----- GVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYC QQYYSTP---- 
L24 VIWMTQSPSLLSASTGDRVTISC RMSQGISS------YLA WYQQKPGKAPELLIY AASTLQS----- GVPSRFSGSGSGTDFTLTISCLQSEDFATYYC QQYYSFP---- 

Framework (FW) and CDR regions are identified according to Kabat definition, Asp residues (D) are underlined in CDR regions. Four Ds in CDRs are not underlined: (1) in Vk21-4 CDR1, (2) in VkA19 CDR1, (3) inVkL6 CDR2, and (4) in VkL4/18a CDR2. Not all human L chains listed in the table, but only those that were found in our survey.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal