Table I.

Loss of E2A in SS tumor cells

Patient no. Loss of E2A Purity of enriched tumor cells 
 Array CGH analysis FISH analysis (number of cells with deletion/number of analyzed cells) 
   % 
1 yesc yes (149/200)e 96.7 
2 yesc n.d – 
3 yesc yes (198/200)e 99.1 
4a yesc yes (167/200)e 93.2 
5 yese yes (90/200)e 97.9 
6 yesd n.d. – 
7a yesc no (14/200)e 99.2f 
8 yese n.d. – 
9 noc no (3/200)e 97.4 
10 noc no (4/200)e 96.9 
11a yese no (12/200)d n.d. 
12 noc n.d. – 
13 yesc yes (126/200)e 98.4f 
14 noc n.d. – 
15a nobc yes (106/200)d n.d. 
16a noe yes (loss 28/200, gain 46/200)e 97.2 
17 yese yes (50/200)e 98.4 
18 yesc n.d. – 
19 yese n.d. – 
20 yese n.d. – 
Se-Ax cell line yes yes (190/200)  
Patient no. Loss of E2A Purity of enriched tumor cells 
 Array CGH analysis FISH analysis (number of cells with deletion/number of analyzed cells) 
   % 
1 yesc yes (149/200)e 96.7 
2 yesc n.d – 
3 yesc yes (198/200)e 99.1 
4a yesc yes (167/200)e 93.2 
5 yese yes (90/200)e 97.9 
6 yesd n.d. – 
7a yesc no (14/200)e 99.2f 
8 yese n.d. – 
9 noc no (3/200)e 97.4 
10 noc no (4/200)e 96.9 
11a yese no (12/200)d n.d. 
12 noc n.d. – 
13 yesc yes (126/200)e 98.4f 
14 noc n.d. – 
15a nobc yes (106/200)d n.d. 
16a noe yes (loss 28/200, gain 46/200)e 97.2 
17 yese yes (50/200)e 98.4 
18 yesc n.d. – 
19 yese n.d. – 
20 yese n.d. – 
Se-Ax cell line yes yes (190/200)  

n.d.: not determined

a

CGH and FISH analyses were performed with samples from different time points (see Table S1).

b

hypotriploid cells, gain of chromosome 19 except 19p13.2-13.3.

c

Analysis of PBMC cells.

d

Analysis of CD4-sorted cells.

e

Analysis of Vβ-sorted cells.

f

Purity was determined with CD4 antibody only.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal