Table 1.
SCAR and WASP orthologues for indicated species (Kollmar et al., 2012) for protein sequences (except for orthologues in Sarracenia rosea, which we identified via BLAST, NCBI identifiers indicated). See also Fig. 8.
SpeciesGroupSCARWASPPseudopod reference
H. sapiens Animals (opisthokont) WAVE1, WAVE2, WAVE3 WASP, N-WASP Ramsey, 1972  
M. brevicollis (orthologues in S. roseaChoanoflagellate (opisthokont) MbWAVE (S. rosea: XP_004994362MbWASP (S. rosea: XP_004997564Pseudopod-based feeding has been observed in all choanoflagellate families (Pettitt et al., 2002); for detailed analysis of pseudopods of S. rosea see Dayel and King, 2014  
C. owczarzaki Opisthokont CoWAVE CoWASP Hertel et al., 2002  
A. nidulans (Representative dikaryon) Fungi (opisthokont) n.f. EnWASP n.f. 
B. dendrobatidis Fungi (opisthokont) Bad_bWAVE Bad_bWASP this work  
A. macrogynus Fungi (opisthokont) AlmWAVE AlmWASP_Aα, AlmWASP_Aβ, AlmWASP_Bα, AlmWASPB_β n.f. 
D. discoideum Amoebozoan SCAR1 DdWASP Raper, 1935  
E. histolytica Amoebozoan n.f. n.f. n.f. 
A. castellanii Amoebozoan AcWAVE AcWASP_A, AcWASP_B, AcWASP_C Bowers and Korn, 1968  
T. trahens++ Apusozoa TctWAVE TctWASP Cavalier-Smith and Chao, 2010  
A. thaliana Plant SCAR1, SCAR2, SCAR3, SCAR4, SCAR-like domain-containing protein n.f. n.f. 
P. ramorum Stramenopile (SAR) n.f. n.f. n.f. 
B. natans Rhizarian (SAR) n.f. BinWASP_A, BinWASP_B n.f. 
P. falciparum Alveolate (SAR) n.f. n.f. n.f. 
T. thermophila Alveolate (SAR) n.f. TtWASP_A, TtWASP_B n.f. 
E. huxleyi Haptophyte n.f. EmhWasp n.f. 
N. gruberi Heterolobosean NgWAVE_A, NgWAVE_B NgWASP_A, NgWASP_B, NgWASP_C, NgWASP_D Fulton, 1970  
G. lamblia Diplomonad n.f. n.f. n.f. 
T. vaginalis Parabasalid Tv_aWAVE_A, Tv_aWAVE_B, Tv_aWAVE_C, Tv_aWAVE_D, Tv_aWAVE_E, Tv_aWAVE_F, Tv_aWAVE_G, Tv_aWAVE_H, Tv_aWAVE_I, Tv_aWAVE_J, Tv_aWAVE_K Tv_aWasp_A, Tv_aWasp_B Kusdian et al., 2013  
SpeciesGroupSCARWASPPseudopod reference
H. sapiens Animals (opisthokont) WAVE1, WAVE2, WAVE3 WASP, N-WASP Ramsey, 1972  
M. brevicollis (orthologues in S. roseaChoanoflagellate (opisthokont) MbWAVE (S. rosea: XP_004994362MbWASP (S. rosea: XP_004997564Pseudopod-based feeding has been observed in all choanoflagellate families (Pettitt et al., 2002); for detailed analysis of pseudopods of S. rosea see Dayel and King, 2014  
C. owczarzaki Opisthokont CoWAVE CoWASP Hertel et al., 2002  
A. nidulans (Representative dikaryon) Fungi (opisthokont) n.f. EnWASP n.f. 
B. dendrobatidis Fungi (opisthokont) Bad_bWAVE Bad_bWASP this work  
A. macrogynus Fungi (opisthokont) AlmWAVE AlmWASP_Aα, AlmWASP_Aβ, AlmWASP_Bα, AlmWASPB_β n.f. 
D. discoideum Amoebozoan SCAR1 DdWASP Raper, 1935  
E. histolytica Amoebozoan n.f. n.f. n.f. 
A. castellanii Amoebozoan AcWAVE AcWASP_A, AcWASP_B, AcWASP_C Bowers and Korn, 1968  
T. trahens++ Apusozoa TctWAVE TctWASP Cavalier-Smith and Chao, 2010  
A. thaliana Plant SCAR1, SCAR2, SCAR3, SCAR4, SCAR-like domain-containing protein n.f. n.f. 
P. ramorum Stramenopile (SAR) n.f. n.f. n.f. 
B. natans Rhizarian (SAR) n.f. BinWASP_A, BinWASP_B n.f. 
P. falciparum Alveolate (SAR) n.f. n.f. n.f. 
T. thermophila Alveolate (SAR) n.f. TtWASP_A, TtWASP_B n.f. 
E. huxleyi Haptophyte n.f. EmhWasp n.f. 
N. gruberi Heterolobosean NgWAVE_A, NgWAVE_B NgWASP_A, NgWASP_B, NgWASP_C, NgWASP_D Fulton, 1970  
G. lamblia Diplomonad n.f. n.f. n.f. 
T. vaginalis Parabasalid Tv_aWAVE_A, Tv_aWAVE_B, Tv_aWAVE_C, Tv_aWAVE_D, Tv_aWAVE_E, Tv_aWAVE_F, Tv_aWAVE_G, Tv_aWAVE_H, Tv_aWAVE_I, Tv_aWAVE_J, Tv_aWAVE_K Tv_aWasp_A, Tv_aWasp_B Kusdian et al., 2013  

Example references for observations of pseudopods are given. Cases where genes or references to cells with active pseudopods were not found are indicated by “n.f.” See also Fig. 8.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal