Table 4.

Up-regulated fibrosis-associated gene transcripts are shared between 9 and 14 d of synchronous regeneration and 10-d asynchronous remodeling

Genes P-value/FC 
 27–time point single regeneration series Double injection LCM series 
 4 d between injections 10 d between injections 
 3/4 da 9/10 da 13/14 da 30/40 da Single siteb In-betweenb Single siteb In-betweenb 
ACTA2 93100_at 0.001 0.006 0.002 NS NS 0.005/8.3 NS 0.008/16.8 
COL6A1 95493_at 0.003 0.0001 0.0001 0.02 NS 0.002/−3.6 NS 0.00004/7.2 
COL18A1 101039_at 0.00001 0.0003 0.01 NS NS NS NS 0.0001/4.0 
COL4A2 101039_at NS 0.01 0.008 NS NS NS NS 0.0007/4.5 
ELN 92207_at NS 0.004 0.02 NS NS NS NS 0.00004/3.2 
MMP14 160118_at 0.0007 0.0002 0.006 NS NS NS NS 0.0006/10.6 
COL14A1 99476_at 0.007 0.004 0.002 NS NS NS NS 0.0003/1.5 
COL15A1 99637_at 0.02 NS 0.006 NS NS NS NS 0.004/1.6 
C2 103673_at 0.02 0.02 NS NS NS NS NS 0.000009/2.6 
STAT3 99099_at 0.02 0.002 0.05 NS NS NS NS 0.003/4.4 
CDKNA1 94881_at 0.03 0.05 0.009 NS NS NS NS 0.00007/3.25 
RAMP2 994444_at NS 0.007 0.006 NS NS NS NS 0.0007/3.5 
ACVR2B 994444_at NS 0.007 0.006 NS NS NS NS 0.0004/6.45 
Genes P-value/FC 
 27–time point single regeneration series Double injection LCM series 
 4 d between injections 10 d between injections 
 3/4 da 9/10 da 13/14 da 30/40 da Single siteb In-betweenb Single siteb In-betweenb 
ACTA2 93100_at 0.001 0.006 0.002 NS NS 0.005/8.3 NS 0.008/16.8 
COL6A1 95493_at 0.003 0.0001 0.0001 0.02 NS 0.002/−3.6 NS 0.00004/7.2 
COL18A1 101039_at 0.00001 0.0003 0.01 NS NS NS NS 0.0001/4.0 
COL4A2 101039_at NS 0.01 0.008 NS NS NS NS 0.0007/4.5 
ELN 92207_at NS 0.004 0.02 NS NS NS NS 0.00004/3.2 
MMP14 160118_at 0.0007 0.0002 0.006 NS NS NS NS 0.0006/10.6 
COL14A1 99476_at 0.007 0.004 0.002 NS NS NS NS 0.0003/1.5 
COL15A1 99637_at 0.02 NS 0.006 NS NS NS NS 0.004/1.6 
C2 103673_at 0.02 0.02 NS NS NS NS NS 0.000009/2.6 
STAT3 99099_at 0.02 0.002 0.05 NS NS NS NS 0.003/4.4 
CDKNA1 94881_at 0.03 0.05 0.009 NS NS NS NS 0.00007/3.25 
RAMP2 994444_at NS 0.007 0.006 NS NS NS NS 0.0007/3.5 
ACVR2B 994444_at NS 0.007 0.006 NS NS NS NS 0.0004/6.45 

The 13 gene transcripts shown were significantly up-regulated in the region between asynchronous injection sites in the double LCM series when injections were separated by 10 d, but not 4 d (0/13). In the 27–time point synchronous regeneration time series, these same transcripts showed the highest and consistent up-regulated between 9 and14 d. FC, fold change.

a

Days are versus 0.

b

Sites are versus nonregenerating.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal