Table 1.

M.I and C.I. resulting from knockdown of every potential Rab-GAP protein during BC migration

Drosophila identifier Common name dsRNA (VDRC no.) M.I. C.I. n Human orthologue 
CG1093 Pollux 27335 N/A N/A N/A TBC1D1 and TBC1D4 
  106969 0.98 0.95 20  
CG1695 CG1695 20340 0.88 0.69 29 SGSM1-2 
  48062 0.98 0.95 22  
  106947 0.875 0.74 34  
CG4041 CG4041 34780 0.83 0.67 3 TBCK 
  108887 0.98 0.95 55  
CG4552 CG4552 40538 0.51 0.30 41 TBC1D23 
  110700 0.98 0.96 47  
CG5337 CG5337 22070 0.99 0.94 17 TBC1D16 
  22069 0.96 0.90 20  
  110067 1.00 1.00 20  
CG5344 Whacked 22081 0.96 0.92 24 TBC1D10A-B-C 
  22082 0.88 0.75 44  
CG5745 CG5745 35034 0.97 0.93 45 TBC1D22A-B 
  35036 0.94 0.84 32  
  108659 1.00 1.00 21  
CG5916 CG5916 110561 0.95 0.90 20 TBC1D6 
CG5978 CG5978 21000 0.98 0.94 72 TBC1D13 
  21001 0.97 0.92 38  
  110396 0.97 0.93 28  
CG6182 CG6182 14705 0.88 0.78 32 TBC1D7 
  14706 0.97 0.93 15  
  106667 0.98 0.94 34  
CG7061a CG7061 27823 0.97 0.94 17 RAB3GAP2 
  27824 0.88 0.79 39  
  106905 0.54 0.41 39  
CG7112 GapcenAb 35174 0.92 0.82 91 RAB-GAP1(GAPCENA) and TBC1D18 
  103588 0.97 0.93 61  
CG7324 CG7324 32929d 0.96 0.89 232 TBC1D8B-9B 
CG7742 CG7742 25535 1.00 1.00 16 TBC1D19 
  25536 0.99 0.97 32  
  100125 0.99 0.96 28  
CG8085 RN-tre 28192ce 0.56 0.36 96 RNTRE (USP6NL), TBC1D28, USP6, TBC1D3F-G-H 
  28194c 0.65 0.42 73  
  108670 0.87 0.75 60  
CG8155 CG8155 24218 0.85 0.75 28 TBC1D25 
  24221 0.58 0.42 31  
  108444 0.99 0.95 22  
CG8449 CG8449 24102 1.00 1.00 17 TBC1D5 
CG9339 CG9339 44655 0.99 0.98 42 TBC1D24 
  108736 0.99 0.96 23  
CG11490 Tbc1d15-17b 20040 0.95 0.90 66 TBC1D15-17 
  1096668 0.94 0.84 51  
CG11727 Evi5b 17548 0.76 0.61 85 EVI5 and EVI5L 
  17549e 0.32 0.14 161  
  105146 0.88 0.73 49  
CG12241 CG12241 33729d 0.95 0.90 201 SGSM3 
CG16896 CG16896 20315 0.82 0.76 17 WDR67 
  20316 0.97 0.88 18  
  107134 0.91 0.81 43  
CG17883 CG17883 30277 0.94 0.83 30 TBC1D20 
CG32506 CG32506 28776d 0.96 0.89 232 SGSM1-2 
CG32580 CG32580 105591 0.99 0.96 24 MUC16 
CG33715 Msp-300 25906 0.97 0.92 83 SYNE1-2 and CLMN 
  40143 1.00 1.00 12  
  40145 0.98 0.95 42  
  50192 0.71 0.58 19  
  107183 0.99 0.98 56  
  109023 0.97 0.93 29  
CG42795 CG42795 17314 0.95 0.90 73 TBC1D30 
  108779 0.98 0.93 29  
Drosophila identifier Common name dsRNA (VDRC no.) M.I. C.I. n Human orthologue 
CG1093 Pollux 27335 N/A N/A N/A TBC1D1 and TBC1D4 
  106969 0.98 0.95 20  
CG1695 CG1695 20340 0.88 0.69 29 SGSM1-2 
  48062 0.98 0.95 22  
  106947 0.875 0.74 34  
CG4041 CG4041 34780 0.83 0.67 3 TBCK 
  108887 0.98 0.95 55  
CG4552 CG4552 40538 0.51 0.30 41 TBC1D23 
  110700 0.98 0.96 47  
CG5337 CG5337 22070 0.99 0.94 17 TBC1D16 
  22069 0.96 0.90 20  
  110067 1.00 1.00 20  
CG5344 Whacked 22081 0.96 0.92 24 TBC1D10A-B-C 
  22082 0.88 0.75 44  
CG5745 CG5745 35034 0.97 0.93 45 TBC1D22A-B 
  35036 0.94 0.84 32  
  108659 1.00 1.00 21  
CG5916 CG5916 110561 0.95 0.90 20 TBC1D6 
CG5978 CG5978 21000 0.98 0.94 72 TBC1D13 
  21001 0.97 0.92 38  
  110396 0.97 0.93 28  
CG6182 CG6182 14705 0.88 0.78 32 TBC1D7 
  14706 0.97 0.93 15  
  106667 0.98 0.94 34  
CG7061a CG7061 27823 0.97 0.94 17 RAB3GAP2 
  27824 0.88 0.79 39  
  106905 0.54 0.41 39  
CG7112 GapcenAb 35174 0.92 0.82 91 RAB-GAP1(GAPCENA) and TBC1D18 
  103588 0.97 0.93 61  
CG7324 CG7324 32929d 0.96 0.89 232 TBC1D8B-9B 
CG7742 CG7742 25535 1.00 1.00 16 TBC1D19 
  25536 0.99 0.97 32  
  100125 0.99 0.96 28  
CG8085 RN-tre 28192ce 0.56 0.36 96 RNTRE (USP6NL), TBC1D28, USP6, TBC1D3F-G-H 
  28194c 0.65 0.42 73  
  108670 0.87 0.75 60  
CG8155 CG8155 24218 0.85 0.75 28 TBC1D25 
  24221 0.58 0.42 31  
  108444 0.99 0.95 22  
CG8449 CG8449 24102 1.00 1.00 17 TBC1D5 
CG9339 CG9339 44655 0.99 0.98 42 TBC1D24 
  108736 0.99 0.96 23  
CG11490 Tbc1d15-17b 20040 0.95 0.90 66 TBC1D15-17 
  1096668 0.94 0.84 51  
CG11727 Evi5b 17548 0.76 0.61 85 EVI5 and EVI5L 
  17549e 0.32 0.14 161  
  105146 0.88 0.73 49  
CG12241 CG12241 33729d 0.95 0.90 201 SGSM3 
CG16896 CG16896 20315 0.82 0.76 17 WDR67 
  20316 0.97 0.88 18  
  107134 0.91 0.81 43  
CG17883 CG17883 30277 0.94 0.83 30 TBC1D20 
CG32506 CG32506 28776d 0.96 0.89 232 SGSM1-2 
CG32580 CG32580 105591 0.99 0.96 24 MUC16 
CG33715 Msp-300 25906 0.97 0.92 83 SYNE1-2 and CLMN 
  40143 1.00 1.00 12  
  40145 0.98 0.95 42  
  50192 0.71 0.58 19  
  107183 0.99 0.98 56  
  109023 0.97 0.93 29  
CG42795 CG42795 17314 0.95 0.90 73 TBC1D30 
  108779 0.98 0.93 29  

N/A, not applicable: this dsRNA line affects drastically the morphology of the egg chamber. VDRC, Vienna Drosophila RNAi Center.

a

This Rab-GAP protein does not have a TBC domain.

b

These common names have been introduced in this study.

c

Crosses were performed at 25°C to minimize morphological phenotypes.

d

Lines obtained from TRiP at Harvard Medical School.

e

This RNAi fly line is used subsequently is this study.

[ViewLarge]
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal