Table 1.

Representation of each Nup84 complex protein

Nup Representation Start residue number End residue number Target–template sequence identity PDB accession no. Template PDB accession no. 
    %   
Nup84 Crystal 442  3iko  
 Gap 443 461    
 Model 462 723 15  2zct 
    19  3cqg 
    19  3cqc 
 Gap 724 726    
Nup133 Gap 62    
 Model 63 481 16  1xks 
 Gap 482 494    
 Model 495 879 15  3i4r 
 Gap 880 945    
 Crystal 946 1,157  3kfo  
Nup85 Crystal 564  3ewe  
 Gap 565 604    
 Model 605 744    
Nup120 Crystal 729  3hxr  
 Spheres 730 1,029    
Nup145c Model 25 129 19  3ez1 
 Crystal 130 552  3bg0  
 Model 553 712 15  1w07 
    29  3cmu 
Nup Representation Start residue number End residue number Target–template sequence identity PDB accession no. Template PDB accession no. 
    %   
Nup84 Crystal 442  3iko  
 Gap 443 461    
 Model 462 723 15  2zct 
    19  3cqg 
    19  3cqc 
 Gap 724 726    
Nup133 Gap 62    
 Model 63 481 16  1xks 
 Gap 482 494    
 Model 495 879 15  3i4r 
 Gap 880 945    
 Crystal 946 1,157  3kfo  
Nup85 Crystal 564  3ewe  
 Gap 565 604    
 Model 605 744    
Nup120 Crystal 729  3hxr  
 Spheres 730 1,029    
Nup145c Model 25 129 19  3ez1 
 Crystal 130 552  3bg0  
 Model 553 712 15  1w07 
    29  3cmu 

Crystal refers to using an x-ray structure from the PDB, Gap refers to an amino acid residue segment represented by spheres, and Model refers to a segment represented by an atomic comparative model. PDB codes are indicated for crystal structures used directly. PDB codes for templates and sequence identities for target–template alignments are indicated where comparative models were used to represent a fragment.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal