Table I.

Nonsynonymous or synonymous variants identified in CDC42 (NM_001791) in probands either with DCM, HCM, LVNC, or congenital heart diseases (Houston study)

Location Nucleotide change Amino acid change Type of variant Patient group Frequency 
 DCM (n = 96) HCM (n = 48) CHD (n = 96) LVNC (n = 91)  
Amplicon1 (Exon 1) c.188G>T V8F NP 6/331 
       (1.8%) 
 c.242A>C N26N 1/331 
        (0.3%) 
 c.256G>A S30S 3/331 
        (0.9%) 
 c.257G>C E31Q NP 46 11 52 29 138/331 
        (41.7%) 
 c.271+6 T>G Intron 3 splice ds NP 7/331 
        (2.1%) 
Amplicon2 (Exon2) c.272-9 insT Intron3 splice as NP 4/331 
       (1.2%) 
 c.272-7 T>C Intron3 splice as NP 15/331 
        (4.5%) 
 c.272-2 T>C Intron3 splice as NP 13/331 
        (3.9%) 
 c.289 A>C A41A 7/331 
        (2.1%) 
 c.295 A>C T43T 5/331 
        (1.5%) 
 c.317 T>C Y51H NP 22 14 10 47/331 
        (14.2%) 
Amplicon4 (Exon 4) c.502T>A L112L 2/331 
       (0.6%) 
 c.513A>C Q116P NP 6/331 
        (1.8%) 
 c.523 C>T L119L 10/331 
        (3.0%) 
 c.525 G>A R120K NP 49 51/331 
        (15.4%) 
 c.628 T>C Y154Y 8/331 
        (2.4%) 
        (rs16826536) 
 c.539 A>G T125A Rare variant 0 0 1 0 1/331 
        (0.3%) 
Amplicon5 (Exon5) c.730 T>G C188W NP 10 12 25/331 
       (7.5%) 
Location Nucleotide change Amino acid change Type of variant Patient group Frequency 
 DCM (n = 96) HCM (n = 48) CHD (n = 96) LVNC (n = 91)  
Amplicon1 (Exon 1) c.188G>T V8F NP 6/331 
       (1.8%) 
 c.242A>C N26N 1/331 
        (0.3%) 
 c.256G>A S30S 3/331 
        (0.9%) 
 c.257G>C E31Q NP 46 11 52 29 138/331 
        (41.7%) 
 c.271+6 T>G Intron 3 splice ds NP 7/331 
        (2.1%) 
Amplicon2 (Exon2) c.272-9 insT Intron3 splice as NP 4/331 
       (1.2%) 
 c.272-7 T>C Intron3 splice as NP 15/331 
        (4.5%) 
 c.272-2 T>C Intron3 splice as NP 13/331 
        (3.9%) 
 c.289 A>C A41A 7/331 
        (2.1%) 
 c.295 A>C T43T 5/331 
        (1.5%) 
 c.317 T>C Y51H NP 22 14 10 47/331 
        (14.2%) 
Amplicon4 (Exon 4) c.502T>A L112L 2/331 
       (0.6%) 
 c.513A>C Q116P NP 6/331 
        (1.8%) 
 c.523 C>T L119L 10/331 
        (3.0%) 
 c.525 G>A R120K NP 49 51/331 
        (15.4%) 
 c.628 T>C Y154Y 8/331 
        (2.4%) 
        (rs16826536) 
 c.539 A>G T125A Rare variant 0 0 1 0 1/331 
        (0.3%) 
Amplicon5 (Exon5) c.730 T>G C188W NP 10 12 25/331 
       (7.5%) 

DCM, dilated cardiac myopathy; HCM, hypertrophic cardiac myopathy; LVNC, left ventricular noncompaction; CHD, congenital heart disease; S, synonymous change; NP, nonsynonymous polymorphism.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal