Primers used in this study
| Primer . | Sequence . |
|---|---|
| SIR4-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGCCAAATGACAATAAG-3′ |
| SIR4-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCATACGGTTTTATCTCCTT-3′ |
| MGA2-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGCAGCAGAACAGTGAGTTC-3′ |
| MGA2-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCCTAACTGACAATTAAATCGTT-3′ |
| SPT23-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGATGAGTGGCACAGGAAAC-3′ |
| SPT23-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCTTAATTGACTCGCATGTCGTT-3′ |
| SIR2-Del-F | 5′-CATTGTTATAGGTCATTTCTTTTCCAAGCTACATCTAGCACTCCTTCCAA CCATGGTCCGGATCCCCGGGTTAATTAA-3′ |
| SIR2-Del-R | 5′-GAATTTGCTGTTCCACCTGCCCTTCTTACATTAAGCTATTTGTGAGAGCCTTGCGGAATTCGAGCTCGTTTAAAC-3′ |
| PAU20-qPCR-F | 5′-GACGAAAGAGTCAACTTGGTG-3′ |
| PAU20-qPCR-R | 5′-TGGTGACTTGGTCTGGGGA-3′ |
| PAUGen-qPCR-F | 5′-GCTACTGCTTCCGCAACCA-3′ |
| PAUGen-qPCR-R | 5′-TCAACATGGTGGTGAAGTCAC-3′ |
| COS5-qPCR-F | 5′-CCAAGAAGCGTTCAGAACAAC-3′ |
| COS5-qPCR-R | 5′-GAAGCTGAACGTCTTCCAGG-3′ |
| COS10-qPCR-F | 5′-CCAGTAGTTCAAATACAGTACAG-3′ |
| COS10-qPCR-F | 5′-GCTTCTTGGCAGTCAGTACC-3′ |
| COSGen-qPCR-F | 5′-AAGATGCAGTTCTTGTCGACTAT-3′ |
| COSGen-qPCR-R | 5′-TCTTTGCAGAGAGAACGCGG-3′ |
| P2-qPCR-F | 5′-ACGATGAGAGACTGTTCAGGTTAAA-3′ |
| P2-qPCR-R | 5′-GGGTTGATGCGTATTGAGAGATA-3′ |
| P3-qPCR-F | 5′-CCAATTGTTCCTCGTTAAGGTATTT-3′ |
| P3-qPCR-R | 5′-ATTCAGGGAGGTAGTGACAATAAA-3′ |
| P4-qPCR-F | 5′-GTTTGAGAATAGGTCAAGGTCATTTC-3′ |
| P4-qPCR-R | 5′-GTTTCCCTCAGGATAGCAGAAG-3′ |
| IGS2-qPCR-F | 5′-CCACCACACTCCTACCAATAAC-3′ |
| IGS2-qPCR-R | 5′-AGGTAGTCAGATGAAAGATGAATAGAC-3′ |
| RPL9A-qPCR-F | 5′-GTCACCAAGGGTTACAAGTACA-3′ |
| RPL9A-qPCR-R | 5′-CAATTTCGTCCTTAACGTTGGTG-3′ |
| RPS26B-qPCR-F | 5′-TACCCAGAATACGCCTTGCC-3′ |
| RPS26B-qPCR-R | 5′-CAAAGCTTTCTTTGCGGCAG-3′ |
| SSB1-qPCR-F | 5′-TTCAAGGTGCTATCTTGACC-3′ |
| SSB1-qPCR-R | 5′-GGTTGTCAGCACATGTAGTA-3′ |
| RPP1B-qPCR-F | 5′-GTCTGGGCTGATGTTTACGC-3′ |
| RPP1B-qPCR-R | 5′-GAAACCCATGTCGTCGTCAG-3′ |
| RPS12-qPCR-F | 5′-AGTTGGTTGAAGGTTTGGCT-3′ |
| RPS12-qPCR-R | 5′-AGTTTCAGCACCCCAGTTCT-3′ |
| RPL8B-qPCR-F | 5′-AGCAAGACGCTTCTCCAAAG-3′ |
| RPL8B-qPCR-R | 5′-TCTTACACAAAGCTGGTAGGAA-3′ |
| RPS22A-qPCR-F | 5′-AGCACGGTTACATTGGTGAA-3′ |
| RPS22A-qPCR-R | 5′-CAGAGGTGGTCAAGATGACG-3′ |
| OPI1-qPCR-F | 5′-CCAGCGAGCAGTCTATTGTG-3′ |
| OPI1-qPCR-R | 5′-CAGTGATGTACTGTGGACGC-3′ |
| INO1-qPCR-F | 5′-GATGTAACGCCCACTGTTCA-3′ |
| INO1-qPCR-R | 5′-AGTCATGGAGCCGAAGTAGT-3′ |
| IZH1-qPCR-F | 5′-TCGGTATCCAAGGGGTTCTT-3′ |
| IZH1-qPCR-R | 5′-TGGCTTTCAAGTGGCATACA-3′ |
| IZH2-qPCR-F | 5′-CCGGAATGGCAAAGAGACAA-3′ |
| IZH2-qPCR-R | 5′-AGTGAAGAACCCGAGAGCAG-3′ |
| IZH3-qPCR-F | 5′-GCTGGGTGTATTTGGTGTGT-3′ |
| IZH3-qPCR-R | 5′-GATTTGTATGTGACGGGGCT-3′ |
| IZH4-qPCR-F | 5′-TCGAACGAGAATGCAGAGAC-3′ |
| IZH4-qPCR-R | 5′-GTGGTGGGGAACAAAGGTATC-3′ |
| OLE1-qPCR-F | 5′-ACCGCTTTCGTCATTCCAAC-3′ |
| OLE1-qPCR-R | 5′-TTGTCACGAGGGGTTCTTCT-3′ |
| SPT23-qPCR-F | 5′-CTAGCATAGAGCCTGACGGA-3′ |
| SPT23-qPCR-R | 5′-ATCATCCACGGTCATTTGGG-3′ |
| ICT1-qPCR-F | 5′-ATGGCGGAAGGATAACAAGC-3′ |
| ICT1-qPCR-R | 5′-AGTGGATAGGTGGTGTTGGG-3′ |
| MGA2-qPCR-F | 5′-CGAGAACAAAGAAGAGCCGC-3′ |
| MGA2-qPCR-R | 5′-TGCCTTATGGTGCCTGCAAT-3′ |
| ACT1-qPCR-F | 5′-TGTCCTTGTACTCTTCCGGT-3′ |
| ACT1-qPCR-R | 5′-CCGGCCAAATCGATTCTCAA-3′ |
| TEL01L-ChIP-F ChrI 82–102 | 5′-CAGCCCTAATCTAACCCTGG-3′ |
| TEL01L-ChIP-R ChrI 300-282 | 5′-GTATGGTGAGTAGGTCATG-3′ |
| TEL06R-ChIP-F ChrVI 269990–270012 | 5′-GTGTGTAGTGATCCGAACTCAGT-3′ |
| TEL06R-ChIP-R ChrVI 270109-270080 | 5′-CTAGCATATTGATATGGCGTACGCACACGT-3′ |
| TEL15L-ChIP-F ChrXV 121–148 | 5′-CCCTAATCTAACCCTGTCCAACCTGTCT-3′ |
| TEL15L-ChIP-R ChrXV 506-481 | 5′-TGGTATATACTATAGCATCCGTGGGC-3′ |
| Lrr-ChIP-F ChrV 469104–469125 | 5′-GCACTTAATTGGCGTAAGCTG-3′ |
| Lrr-ChIP-R ChrV 469157–469177 | 5′-TCGCAGGAGCATATTTCGTA-3′ |
| Primer . | Sequence . |
|---|---|
| SIR4-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGCCAAATGACAATAAG-3′ |
| SIR4-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCATACGGTTTTATCTCCTT-3′ |
| MGA2-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGCAGCAGAACAGTGAGTTC-3′ |
| MGA2-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCCTAACTGACAATTAAATCGTT-3′ |
| SPT23-gateway-F | 5′-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTCTATGATGAGTGGCACAGGAAAC-3′ |
| SPT23-gateway-R | 5′-GGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTCTTAATTGACTCGCATGTCGTT-3′ |
| SIR2-Del-F | 5′-CATTGTTATAGGTCATTTCTTTTCCAAGCTACATCTAGCACTCCTTCCAA CCATGGTCCGGATCCCCGGGTTAATTAA-3′ |
| SIR2-Del-R | 5′-GAATTTGCTGTTCCACCTGCCCTTCTTACATTAAGCTATTTGTGAGAGCCTTGCGGAATTCGAGCTCGTTTAAAC-3′ |
| PAU20-qPCR-F | 5′-GACGAAAGAGTCAACTTGGTG-3′ |
| PAU20-qPCR-R | 5′-TGGTGACTTGGTCTGGGGA-3′ |
| PAUGen-qPCR-F | 5′-GCTACTGCTTCCGCAACCA-3′ |
| PAUGen-qPCR-R | 5′-TCAACATGGTGGTGAAGTCAC-3′ |
| COS5-qPCR-F | 5′-CCAAGAAGCGTTCAGAACAAC-3′ |
| COS5-qPCR-R | 5′-GAAGCTGAACGTCTTCCAGG-3′ |
| COS10-qPCR-F | 5′-CCAGTAGTTCAAATACAGTACAG-3′ |
| COS10-qPCR-F | 5′-GCTTCTTGGCAGTCAGTACC-3′ |
| COSGen-qPCR-F | 5′-AAGATGCAGTTCTTGTCGACTAT-3′ |
| COSGen-qPCR-R | 5′-TCTTTGCAGAGAGAACGCGG-3′ |
| P2-qPCR-F | 5′-ACGATGAGAGACTGTTCAGGTTAAA-3′ |
| P2-qPCR-R | 5′-GGGTTGATGCGTATTGAGAGATA-3′ |
| P3-qPCR-F | 5′-CCAATTGTTCCTCGTTAAGGTATTT-3′ |
| P3-qPCR-R | 5′-ATTCAGGGAGGTAGTGACAATAAA-3′ |
| P4-qPCR-F | 5′-GTTTGAGAATAGGTCAAGGTCATTTC-3′ |
| P4-qPCR-R | 5′-GTTTCCCTCAGGATAGCAGAAG-3′ |
| IGS2-qPCR-F | 5′-CCACCACACTCCTACCAATAAC-3′ |
| IGS2-qPCR-R | 5′-AGGTAGTCAGATGAAAGATGAATAGAC-3′ |
| RPL9A-qPCR-F | 5′-GTCACCAAGGGTTACAAGTACA-3′ |
| RPL9A-qPCR-R | 5′-CAATTTCGTCCTTAACGTTGGTG-3′ |
| RPS26B-qPCR-F | 5′-TACCCAGAATACGCCTTGCC-3′ |
| RPS26B-qPCR-R | 5′-CAAAGCTTTCTTTGCGGCAG-3′ |
| SSB1-qPCR-F | 5′-TTCAAGGTGCTATCTTGACC-3′ |
| SSB1-qPCR-R | 5′-GGTTGTCAGCACATGTAGTA-3′ |
| RPP1B-qPCR-F | 5′-GTCTGGGCTGATGTTTACGC-3′ |
| RPP1B-qPCR-R | 5′-GAAACCCATGTCGTCGTCAG-3′ |
| RPS12-qPCR-F | 5′-AGTTGGTTGAAGGTTTGGCT-3′ |
| RPS12-qPCR-R | 5′-AGTTTCAGCACCCCAGTTCT-3′ |
| RPL8B-qPCR-F | 5′-AGCAAGACGCTTCTCCAAAG-3′ |
| RPL8B-qPCR-R | 5′-TCTTACACAAAGCTGGTAGGAA-3′ |
| RPS22A-qPCR-F | 5′-AGCACGGTTACATTGGTGAA-3′ |
| RPS22A-qPCR-R | 5′-CAGAGGTGGTCAAGATGACG-3′ |
| OPI1-qPCR-F | 5′-CCAGCGAGCAGTCTATTGTG-3′ |
| OPI1-qPCR-R | 5′-CAGTGATGTACTGTGGACGC-3′ |
| INO1-qPCR-F | 5′-GATGTAACGCCCACTGTTCA-3′ |
| INO1-qPCR-R | 5′-AGTCATGGAGCCGAAGTAGT-3′ |
| IZH1-qPCR-F | 5′-TCGGTATCCAAGGGGTTCTT-3′ |
| IZH1-qPCR-R | 5′-TGGCTTTCAAGTGGCATACA-3′ |
| IZH2-qPCR-F | 5′-CCGGAATGGCAAAGAGACAA-3′ |
| IZH2-qPCR-R | 5′-AGTGAAGAACCCGAGAGCAG-3′ |
| IZH3-qPCR-F | 5′-GCTGGGTGTATTTGGTGTGT-3′ |
| IZH3-qPCR-R | 5′-GATTTGTATGTGACGGGGCT-3′ |
| IZH4-qPCR-F | 5′-TCGAACGAGAATGCAGAGAC-3′ |
| IZH4-qPCR-R | 5′-GTGGTGGGGAACAAAGGTATC-3′ |
| OLE1-qPCR-F | 5′-ACCGCTTTCGTCATTCCAAC-3′ |
| OLE1-qPCR-R | 5′-TTGTCACGAGGGGTTCTTCT-3′ |
| SPT23-qPCR-F | 5′-CTAGCATAGAGCCTGACGGA-3′ |
| SPT23-qPCR-R | 5′-ATCATCCACGGTCATTTGGG-3′ |
| ICT1-qPCR-F | 5′-ATGGCGGAAGGATAACAAGC-3′ |
| ICT1-qPCR-R | 5′-AGTGGATAGGTGGTGTTGGG-3′ |
| MGA2-qPCR-F | 5′-CGAGAACAAAGAAGAGCCGC-3′ |
| MGA2-qPCR-R | 5′-TGCCTTATGGTGCCTGCAAT-3′ |
| ACT1-qPCR-F | 5′-TGTCCTTGTACTCTTCCGGT-3′ |
| ACT1-qPCR-R | 5′-CCGGCCAAATCGATTCTCAA-3′ |
| TEL01L-ChIP-F ChrI 82–102 | 5′-CAGCCCTAATCTAACCCTGG-3′ |
| TEL01L-ChIP-R ChrI 300-282 | 5′-GTATGGTGAGTAGGTCATG-3′ |
| TEL06R-ChIP-F ChrVI 269990–270012 | 5′-GTGTGTAGTGATCCGAACTCAGT-3′ |
| TEL06R-ChIP-R ChrVI 270109-270080 | 5′-CTAGCATATTGATATGGCGTACGCACACGT-3′ |
| TEL15L-ChIP-F ChrXV 121–148 | 5′-CCCTAATCTAACCCTGTCCAACCTGTCT-3′ |
| TEL15L-ChIP-R ChrXV 506-481 | 5′-TGGTATATACTATAGCATCCGTGGGC-3′ |
| Lrr-ChIP-F ChrV 469104–469125 | 5′-GCACTTAATTGGCGTAAGCTG-3′ |
| Lrr-ChIP-R ChrV 469157–469177 | 5′-TCGCAGGAGCATATTTCGTA-3′ |