Skip to Main Content
Table I.

Immunogenic proteins, peptides tested, and CD8+ T cell epitopes


Gene

H-2

Function

Timea

Peptides testedb

IC50 (nM)c

Determinantd

Namee
B8R Kb soluble IFN-γ receptor early  TSYKFESV  0.19  TSYKFESV B8R20-27 
     WQTMYTNV  6.6   
     ISLKNYGI  16   
     LAVLFINSI  28   
     KVEEYCTGL  129   
A19L Kb unknown –  VSLDYINTM  0.77  VSLDYINTM A19L47-55 
     SDITKVSL  1,261   
     VKISDITKV  4,930   
A47L Kb unknown –  TIQRFSSL  1.1   
     AAFEFINSL  1.3  AAFEFINSL A47L138-146 
     ATIQRFSSL  1.3   
     VSDLYTSM  7.0   
     LTPIFSDLL  7.3   
A42R Db profilin homologue late  YAPVSPIVI  0.24  YAPVSPIVI A42R88-96 
     FAKINPGEI  54   
     LMDENTYAM  767   
     MYAPVSPIVI  1,266   
     FAKINPGEII  2,071   
K3L Db IFN resistance early  YSLPNAGDVI  0.22  YSLPNAGDVI K3L6-15 
     YSLPNAGDV  102   

 

 

 

 
 YIDVNYKRM
 
 5,138
 

 

 

Gene

H-2

Function

Timea

Peptides testedb

IC50 (nM)c

Determinantd

Namee
B8R Kb soluble IFN-γ receptor early  TSYKFESV  0.19  TSYKFESV B8R20-27 
     WQTMYTNV  6.6   
     ISLKNYGI  16   
     LAVLFINSI  28   
     KVEEYCTGL  129   
A19L Kb unknown –  VSLDYINTM  0.77  VSLDYINTM A19L47-55 
     SDITKVSL  1,261   
     VKISDITKV  4,930   
A47L Kb unknown –  TIQRFSSL  1.1   
     AAFEFINSL  1.3  AAFEFINSL A47L138-146 
     ATIQRFSSL  1.3   
     VSDLYTSM  7.0   
     LTPIFSDLL  7.3   
A42R Db profilin homologue late  YAPVSPIVI  0.24  YAPVSPIVI A42R88-96 
     FAKINPGEI  54   
     LMDENTYAM  767   
     MYAPVSPIVI  1,266   
     FAKINPGEII  2,071   
K3L Db IFN resistance early  YSLPNAGDVI  0.22  YSLPNAGDVI K3L6-15 
     YSLPNAGDV  102   

 

 

 

 
 YIDVNYKRM
 
 5,138
 

 

 
a

Class of VACV gene as published: early, late, or unknown.

b

Top five peptides (by H-2 binding) predicted for each gene. Total peptides tested: B8R, 28; A19L, 3; A47L, 45; A42R, 7; and K3L, 3.

c

Peptide binding to relevant H-2 molecule.

d

CD8+ T cell determinant as determined by T cell assays.

e

Name used for determinant is gene name followed by amino acid position.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal