Skip to Main Content
Table 2

List of Genes and Crossed Nomenclature of the cag Pathogenicity Island of H. pylori

Nomenclature of cag genes according toProperties of single gene inactivation in the cag region
Tomb et al. Akopyants et al. Censini et al. IL-8 secretion NF-κB activation CagA–Ptyr translocation 
ND ND G27wt,cag
ND ND G27Δcag − − − 
HP0520 cagORF6 cagζ ND ND ND 
HP0521 cagORF7 cagε − ND ND 
HP0522 cagORF8 cagδ ND ND ND 
HP0523 cagORF9 cagγ ND ND ND 
HP0524 cagORF10 cagβ(virD4++ ND − 
HP0525 ORF11 cagα(virB11− ND − 
HP0526 cagORF12 cagND ND ND 
HP0527 cagORF13 cagY(virB10− ND − 
HP0527 cagORF14 ND − ND ND 
HP0528 cagORF15 cagX(virB9− ND − 
HP0529 cagORF16 cagW(virB8− ND ND 
HP0530 cag10 ORF17 cagND ND ND 
HP0531 cag11 ORF18 cag− ND ND 
HP0532 cag12 ORF19 cagT(virB7− ND ND 
HP0533 ND ND ND ND ND 
HP0534 cag13 ORF20 cag− ND ND 
ND ORF21 tnpND ND ND 
ND ORF22 tnpND ND ND 
HP0535 cag14 ND cagND ND ND 
ND ND cagND ND ND 
HP0536 cag15 ND cagND ND ND 
ND ND cagND ND ND 
HP0537 cag16 ND cag− − − 
HP0538 cag17 ND cag
HP0539 cag18 ND cag− − − 
HP0540 cag19 ND cag− − − 
HP0541 cag20 ND cag− − − 
HP0542 cag21 ND cag− − − 
HP0543 cag22 ND cag− − 
HP0544 cag23 ND cagE(virB4), pic− − − 
HP0545 cag24 ND cag − ND − 
HP0546 cag25 ND cag − ND − 
ND ND cag − ND − 
HP0547 cag26 ND cag− 
HP0548 ND cagΩ ND ND ND 
HP0549 glr ND glr ND ND ND 
Nomenclature of cag genes according toProperties of single gene inactivation in the cag region
Tomb et al. Akopyants et al. Censini et al. IL-8 secretion NF-κB activation CagA–Ptyr translocation 
ND ND G27wt,cag
ND ND G27Δcag − − − 
HP0520 cagORF6 cagζ ND ND ND 
HP0521 cagORF7 cagε − ND ND 
HP0522 cagORF8 cagδ ND ND ND 
HP0523 cagORF9 cagγ ND ND ND 
HP0524 cagORF10 cagβ(virD4++ ND − 
HP0525 ORF11 cagα(virB11− ND − 
HP0526 cagORF12 cagND ND ND 
HP0527 cagORF13 cagY(virB10− ND − 
HP0527 cagORF14 ND − ND ND 
HP0528 cagORF15 cagX(virB9− ND − 
HP0529 cagORF16 cagW(virB8− ND ND 
HP0530 cag10 ORF17 cagND ND ND 
HP0531 cag11 ORF18 cag− ND ND 
HP0532 cag12 ORF19 cagT(virB7− ND ND 
HP0533 ND ND ND ND ND 
HP0534 cag13 ORF20 cag− ND ND 
ND ORF21 tnpND ND ND 
ND ORF22 tnpND ND ND 
HP0535 cag14 ND cagND ND ND 
ND ND cagND ND ND 
HP0536 cag15 ND cagND ND ND 
ND ND cagND ND ND 
HP0537 cag16 ND cag− − − 
HP0538 cag17 ND cag
HP0539 cag18 ND cag− − − 
HP0540 cag19 ND cag− − − 
HP0541 cag20 ND cag− − − 
HP0542 cag21 ND cag− − − 
HP0543 cag22 ND cag− − 
HP0544 cag23 ND cagE(virB4), pic− − − 
HP0545 cag24 ND cag − ND − 
HP0546 cag25 ND cag − ND − 
ND ND cag − ND − 
HP0547 cag26 ND cag− 
HP0548 ND cagΩ ND ND ND 
HP0549 glr ND glr ND ND ND 

List of genes and crossed nomenclature of the cag pathogenicity island of H. pylori and of the effects on IL-8 secretion, NF-κB activation, and CagA translocation and tyrosine phosphorylation after single gene inactivation. Type IV homologues are indicated in bold type in parentheses. The CagE gene was also independently identified by Tummuru et al. as picB (reference 20). The wild-type G27 strain and its mutant derivative Δcag are positive and negative controls.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal