Skip to Main Content
Table 2

Summary of Single Cell PCR Analysis of Three Cases of cHD

CaseGene locusStaining for micromanipulationH/RS cells positivePCR productsRearrangements or germline configurationBuffer controls positive
TotalSequencedRepeatedUnique
IgH CD30 21/50 19 VH17 17 VH 0/15 
    1 VH 1 VH 
    1 VH 1 VH 
   9/14 9 DH3–JH 9 DH3-9–JH6c  0/4 
  Granzyme B 3/15 3 VH3 VH  
 Igκ CD30 0/16     0/4 
 Igλ CD30 0/8     0/4 
 TCR Cβ1 CD30 9/20 9 germline 9 germline  0/14 
  Granzyme B 3/15 3 germline 3 germline   
 TCR Cβ2 CD30 9/20 9 germline 9 germline  0/14 
  Granzyme B 3/15 3 germline 2 germline   
 EBNA1 CD30 7/10 7 EBNA1    0/4 
II IgH CD30 8/20 6 VH6 VH 0/6 
    7 VH6 VH  
  TIA-1 3/10 2 VH2 VH 0/6 
    3 VH2 VH  
 Igκ CD30 9/20 9 Vκ1 7 Vκ1  0/6 
  TIA-1 2/10 3 Vκ1 2 Vκ1   
 TCR Cβ1 CD30 4/20 4 germline    0/4 
  TIA-1 6/10 6 germline     
 TCR Cβ2 CD30 9/20 9 germline    0/4 
  TIA-1 4/10 4 germline     
 EBNA1 CD30 8/20 8 EBNA1    0/6 
  TIA-1 5/10 5 EBNA1     
III IgH CD30 1/30 1 VH 1 VH0/10 
   6/15 6 germline 6 germline  0/4 
 Igκ CD30 0/30     0/10 
 Igλ CD30 0/30     0/10 
 TCR Cβ1 CD30 20/30 14 Vβ7 14 14 Vβ7  1/10 
    14 Dβ1–Jβ1 14 14 Dβ1–Jβ1.4   
    1 germline  1 germline  
 TCR Cβ2 CD30 17/30 17 germline 7 germline  0/10 
 EBNA1 CD30 0/10     0/4 
Controls:  Micromanipulated Sorted by flow cytometry   
 Gene locus B cells T cells B cells T cells   
 IgH VDJ 5/22 0/12 8/15    
  DJ/germline   9/10    
 Igκ  3/14  4/7    
 Igλ  3/14  3/7    
 TCR-β VDJ  6/22  7/9   
  DJ/germline 16/22  16/18    
CaseGene locusStaining for micromanipulationH/RS cells positivePCR productsRearrangements or germline configurationBuffer controls positive
TotalSequencedRepeatedUnique
IgH CD30 21/50 19 VH17 17 VH 0/15 
    1 VH 1 VH 
    1 VH 1 VH 
   9/14 9 DH3–JH 9 DH3-9–JH6c  0/4 
  Granzyme B 3/15 3 VH3 VH  
 Igκ CD30 0/16     0/4 
 Igλ CD30 0/8     0/4 
 TCR Cβ1 CD30 9/20 9 germline 9 germline  0/14 
  Granzyme B 3/15 3 germline 3 germline   
 TCR Cβ2 CD30 9/20 9 germline 9 germline  0/14 
  Granzyme B 3/15 3 germline 2 germline   
 EBNA1 CD30 7/10 7 EBNA1    0/4 
II IgH CD30 8/20 6 VH6 VH 0/6 
    7 VH6 VH  
  TIA-1 3/10 2 VH2 VH 0/6 
    3 VH2 VH  
 Igκ CD30 9/20 9 Vκ1 7 Vκ1  0/6 
  TIA-1 2/10 3 Vκ1 2 Vκ1   
 TCR Cβ1 CD30 4/20 4 germline    0/4 
  TIA-1 6/10 6 germline     
 TCR Cβ2 CD30 9/20 9 germline    0/4 
  TIA-1 4/10 4 germline     
 EBNA1 CD30 8/20 8 EBNA1    0/6 
  TIA-1 5/10 5 EBNA1     
III IgH CD30 1/30 1 VH 1 VH0/10 
   6/15 6 germline 6 germline  0/4 
 Igκ CD30 0/30     0/10 
 Igλ CD30 0/30     0/10 
 TCR Cβ1 CD30 20/30 14 Vβ7 14 14 Vβ7  1/10 
    14 Dβ1–Jβ1 14 14 Dβ1–Jβ1.4   
    1 germline  1 germline  
 TCR Cβ2 CD30 17/30 17 germline 7 germline  0/10 
 EBNA1 CD30 0/10     0/4 
Controls:  Micromanipulated Sorted by flow cytometry   
 Gene locus B cells T cells B cells T cells   
 IgH VDJ 5/22 0/12 8/15    
  DJ/germline   9/10    
 Igκ  3/14  4/7    
 Igλ  3/14  3/7    
 TCR-β VDJ  6/22  7/9   
  DJ/germline 16/22  16/18    
Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal